应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP计算H原子 吸附在Pt(111)表面时，最后CONTCAR 里少了H 原子
41/1返回列表
查看: 1780  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wwm09

金虫 (小有名气)

[求助] VASP计算H原子 吸附在Pt(111)表面时，最后CONTCAR 里少了H 原子 已有1人参与

RT，请各位帮忙看看这是怎么回事？谢谢
OUTCAR算出的能量与Pt Slab能量相同（因为H原子失踪了）。
CONTCAR 如下
Pt : Pt(111) [3x3, 4 layers]       %%（这一行的末尾出现了^M可能是问题的原因，但重新输入后情况不变）     
    1.000000000000000     
     8.4946150000000000    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     4.2473080000000000    7.3565330000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   23.1194100000000000
  36
Selective dynamics
Direct
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.3333333333333357  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.6666666666666643  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.0000000000000000  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
  0.3333333333333357  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
  0.6666666666666643  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
  0.0000000000000000  0.6666666666666643  0.1000000000000014   F   F   F
  0.3333333333333357  0.6666666666666643  0.1000000000000014   F   F   F
  0.6666666666666643  0.6666666666666643  0.1000000000000014   F   F   F
  0.1111111111111143  0.1111111111111143  0.2000000000000028   F   F   F
  0.4444444444444429  0.1111111111111143  0.2000000000000028   F   F   F
  0.7777777777777786  0.1111111111111143  0.2000000000000028   F   F   F
  0.1111111111111143  0.4444444444444429  0.2000000000000028   F   F   F
  0.4444444444444429  0.4444444444444429  0.2000000000000028   F   F   F
  0.7777777777777786  0.4444444444444429  0.2000000000000028   F   F   F
  0.1111111111111143  0.7777777777777786  0.2000000000000028   F   F   F
  0.4444444444444429  0.7777777777777786  0.2000000000000028   F   F   F
  0.7777777777777786  0.7777777777777786  0.2000000000000028   F   F   F
  0.2222213112969953  0.2222221586930037  0.2979456023088535   T   T   T
  0.5555589726304304  0.2222202040481568  0.2979468607458601   T   T   T
  0.8888882657457644  0.2222215254295242  0.2979456008258409   T   T   T
  0.2222215526504422  0.5555568170627582  0.2979464874142188   T   T   T
  0.5555570287112902  0.5555555662755211  0.2979463665621376   T   T   T
  0.8888874742401857  0.5555564182463390  0.2979456572516460   T   T   T
  0.2222209540158847  0.8888898822528157  0.2979462539650056   T   T   T
  0.5555575642905256  0.8888883369427688  0.2979464273376182   T   T   T
  0.8888873025750039  0.8888913435780719  0.2979468240197610   T   T   T
-0.0000005869246331  0.0000001295319143  0.3977266161334645   T   T   T
  0.3333329046084976 -0.0000003446841020  0.3977275955378024   T   T   T
  0.6666677464588719  0.0000004437582833  0.3977272584943250   T   T   T
-0.0000007365677513  0.3333328967949707  0.3977266745040140   T   T   T
  0.3333341801306240  0.3333336301116413  0.3977275688338358   T   T   T
  0.6666671245051308  0.3333326688445418  0.3977267421620061   T   T   T
  0.0000001833473612  0.6666675805750582  0.3977270625181429   T   T   T
  0.3333331400601637  0.6666666154746798  0.3977270419197222   T   T   T
  0.6666667103885983  0.6666660198215224  0.3977274731344342   T   T   T

  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00

POSCAR如下：
Pt H : H-Pt(111) [3x3, 4 layers]
1.00000000000000
+8.4946150000  +0.0000000000  +0.0000000000
+4.2473080000  +7.3565330000  +0.0000000000
+0.0000000000  +0.0000000000 +23.1194100000
36 1
Selective
Cartesian
+0.0000000000  +0.0000000000  +2.3119410000  F F F
+2.8315383333  +0.0000000000  +2.3119410000  F F F
+5.6630766667  +0.0000000000  +2.3119410000  F F F
+1.4157693333  +2.4521776667  +2.3119410000  F F F
+4.2473076667  +2.4521776667  +2.3119410000  F F F
+7.0788460000  +2.4521776667  +2.3119410000  F F F
+2.8315386667  +4.9043553333  +2.3119410000  F F F
+5.6630770000  +4.9043553333  +2.3119410000  F F F
+8.4946153333  +4.9043553333  +2.3119410000  F F F
+1.4157692222  +0.8173925556  +4.6238820000  F F F
+4.2473075556  +0.8173925556  +4.6238820000  F F F
+7.0788458889  +0.8173925556  +4.6238820000  F F F
+2.8315385556  +3.2695702222  +4.6238820000  F F F
+5.6630768889  +3.2695702222  +4.6238820000  F F F
+8.4946152222  +3.2695702222  +4.6238820000  F F F
+4.2473078889  +5.7217478889  +4.6238820000  F F F
+7.0788462222  +5.7217478889  +4.6238820000  F F F
+9.9103845556  +5.7217478889  +4.6238820000  F F F
+2.8315384444  +1.6347851111  +6.9358230000  T T T
+5.6630767778  +1.6347851111  +6.9358230000  T T T
+8.4946151111  +1.6347851111  +6.9358230000  T T T
+4.2473077778  +4.0869627778  +6.9358230000  T T T
+7.0788461111  +4.0869627778  +6.9358230000  T T T
+9.9103844444  +4.0869627778  +6.9358230000  T T T
+5.6630771111  +6.5391404444  +6.9358230000  T T T
+8.4946154444  +6.5391404444  +6.9358230000  T T T
+11.3261537778  +6.5391404444  +6.9358230000  T T T
+0.0000000000  +0.0000000000  +9.2477640000  T T T
+2.8315383333  +0.0000000000  +9.2477640000  T T T
+5.6630766667  +0.0000000000  +9.2477640000  T T T
+1.4157693333  +2.4521776667  +9.2477640000  T T T
+4.2473076667  +2.4521776667  +9.2477640000  T T T
+7.0788460000  +2.4521776667  +9.2477640000  T T T
+2.8315386667  +4.9043553333  +9.2477640000  T T T
+5.6630770000  +4.9043553333  +9.2477640000  T T T
+8.4946153333  +4.9043553333  +9.2477640000  T T T
+4.2473080000  +2.4521780000 +10.5597050000  T T T
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VASP计算

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
youcanyouup
1楼 2014-01-08 06:30:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

零下1℃

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
LZ你的POTCAR文件里面是不是忘记加上H原子的势函数了？？
赞一下 回复此楼
2楼2014-01-08 10:11:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wwm09

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 零下1℃ at 2014-01-07 21:11:47
LZ你的POTCAR文件里面是不是忘记加上H原子的势函数了？？

加了，所以觉得比较奇怪
赞一下 回复此楼
youcanyouup
3楼2014-01-08 22:51:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

零下1℃

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wwm09 at 2014-01-08 22:51:14
加了，所以觉得比较奇怪...

LZ请你确认一下，你在POSCAR里面的顺序先Pt后H，与POTCAR文件里面是否一直的？如果是一直的，建议将H原子放在前面在试一次，因为我们掺杂的时候一般都是把掺杂原子放在前面，基体原子放在后面的。
赞一下 回复此楼
4楼2014-01-09 08:46:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wwm09 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 8/400 2026-04-21 16:26 by 啃面包的小书虫
[考研] 295分求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-17 6/300 2026-04-21 08:18 by Equinoxhua
[考研] 一志愿中科大材料与化工，353分还有调剂学校吗 +11 否极泰来2026 2026-04-15 13/650 2026-04-20 22:31 by Equinoxhua
[考研] 085600材料与化工调剂 5+3 孜孜不倦2002 2026-04-19 6/300 2026-04-20 21:25 by babero
[论文投稿] 期刊推荐 +3 材料研究生 2026-04-15 5/250 2026-04-20 16:02 by 豆豆7758
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀，最好在一个月之内的，研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[教师之家] 又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗 +4 yexuqing 2026-04-19 4/200 2026-04-20 14:47 by brantleo
[考研] 337求调剂 +3 jyz04 2026-04-18 3/150 2026-04-20 12:24 by 研可安
[考博] 申博 +3 Xyyx. 2026-04-18 3/150 2026-04-20 10:44 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-17 9/450 2026-04-19 19:51 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 294求调剂 +15 淡然654321 2026-04-15 15/750 2026-04-19 08:20 by cuisz
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 300求调剂 +12 橙a777 2026-04-15 12/600 2026-04-18 23:51 by 路病情
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 急需调剂 +9 绝不放弃22 2026-04-15 10/500 2026-04-18 08:09 by chixmc
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 一志愿沪9，生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭