应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP计算H原子 吸附在Pt(111)表面时，最后CONTCAR 里少了H 原子
31/1返回列表
查看: 1466  |  回复: 3
查看全部回帖@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者wwm09将赠送您 5 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

wwm09

金虫 (小有名气)

[求助] VASP计算H原子 吸附在Pt(111)表面时，最后CONTCAR 里少了H 原子已有1人参与

RT，请各位帮忙看看这是怎么回事？谢谢
OUTCAR算出的能量与Pt Slab能量相同（因为H原子失踪了）。
CONTCAR 如下
Pt : Pt(111) [3x3, 4 layers]       %%（这一行的末尾出现了^M可能是问题的原因，但重新输入后情况不变）     
    1.000000000000000     
     8.4946150000000000    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     4.2473080000000000    7.3565330000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   23.1194100000000000
  36
Selective dynamics
Direct
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.3333333333333357  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.6666666666666643  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.0000000000000000  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
  0.3333333333333357  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
  0.6666666666666643  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
  0.0000000000000000  0.6666666666666643  0.1000000000000014   F   F   F
  0.3333333333333357  0.6666666666666643  0.1000000000000014   F   F   F
  0.6666666666666643  0.6666666666666643  0.1000000000000014   F   F   F
  0.1111111111111143  0.1111111111111143  0.2000000000000028   F   F   F
  0.4444444444444429  0.1111111111111143  0.2000000000000028   F   F   F
  0.7777777777777786  0.1111111111111143  0.2000000000000028   F   F   F
  0.1111111111111143  0.4444444444444429  0.2000000000000028   F   F   F
  0.4444444444444429  0.4444444444444429  0.2000000000000028   F   F   F
  0.7777777777777786  0.4444444444444429  0.2000000000000028   F   F   F
  0.1111111111111143  0.7777777777777786  0.2000000000000028   F   F   F
  0.4444444444444429  0.7777777777777786  0.2000000000000028   F   F   F
  0.7777777777777786  0.7777777777777786  0.2000000000000028   F   F   F
  0.2222213112969953  0.2222221586930037  0.2979456023088535   T   T   T
  0.5555589726304304  0.2222202040481568  0.2979468607458601   T   T   T
  0.8888882657457644  0.2222215254295242  0.2979456008258409   T   T   T
  0.2222215526504422  0.5555568170627582  0.2979464874142188   T   T   T
  0.5555570287112902  0.5555555662755211  0.2979463665621376   T   T   T
  0.8888874742401857  0.5555564182463390  0.2979456572516460   T   T   T
  0.2222209540158847  0.8888898822528157  0.2979462539650056   T   T   T
  0.5555575642905256  0.8888883369427688  0.2979464273376182   T   T   T
  0.8888873025750039  0.8888913435780719  0.2979468240197610   T   T   T
-0.0000005869246331  0.0000001295319143  0.3977266161334645   T   T   T
  0.3333329046084976 -0.0000003446841020  0.3977275955378024   T   T   T
  0.6666677464588719  0.0000004437582833  0.3977272584943250   T   T   T
-0.0000007365677513  0.3333328967949707  0.3977266745040140   T   T   T
  0.3333341801306240  0.3333336301116413  0.3977275688338358   T   T   T
  0.6666671245051308  0.3333326688445418  0.3977267421620061   T   T   T
  0.0000001833473612  0.6666675805750582  0.3977270625181429   T   T   T
  0.3333331400601637  0.6666666154746798  0.3977270419197222   T   T   T
  0.6666667103885983  0.6666660198215224  0.3977274731344342   T   T   T

  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00

POSCAR如下：
Pt H : H-Pt(111) [3x3, 4 layers]
1.00000000000000
+8.4946150000  +0.0000000000  +0.0000000000
+4.2473080000  +7.3565330000  +0.0000000000
+0.0000000000  +0.0000000000 +23.1194100000
36 1
Selective
Cartesian
+0.0000000000  +0.0000000000  +2.3119410000  F F F
+2.8315383333  +0.0000000000  +2.3119410000  F F F
+5.6630766667  +0.0000000000  +2.3119410000  F F F
+1.4157693333  +2.4521776667  +2.3119410000  F F F
+4.2473076667  +2.4521776667  +2.3119410000  F F F
+7.0788460000  +2.4521776667  +2.3119410000  F F F
+2.8315386667  +4.9043553333  +2.3119410000  F F F
+5.6630770000  +4.9043553333  +2.3119410000  F F F
+8.4946153333  +4.9043553333  +2.3119410000  F F F
+1.4157692222  +0.8173925556  +4.6238820000  F F F
+4.2473075556  +0.8173925556  +4.6238820000  F F F
+7.0788458889  +0.8173925556  +4.6238820000  F F F
+2.8315385556  +3.2695702222  +4.6238820000  F F F
+5.6630768889  +3.2695702222  +4.6238820000  F F F
+8.4946152222  +3.2695702222  +4.6238820000  F F F
+4.2473078889  +5.7217478889  +4.6238820000  F F F
+7.0788462222  +5.7217478889  +4.6238820000  F F F
+9.9103845556  +5.7217478889  +4.6238820000  F F F
+2.8315384444  +1.6347851111  +6.9358230000  T T T
+5.6630767778  +1.6347851111  +6.9358230000  T T T
+8.4946151111  +1.6347851111  +6.9358230000  T T T
+4.2473077778  +4.0869627778  +6.9358230000  T T T
+7.0788461111  +4.0869627778  +6.9358230000  T T T
+9.9103844444  +4.0869627778  +6.9358230000  T T T
+5.6630771111  +6.5391404444  +6.9358230000  T T T
+8.4946154444  +6.5391404444  +6.9358230000  T T T
+11.3261537778  +6.5391404444  +6.9358230000  T T T
+0.0000000000  +0.0000000000  +9.2477640000  T T T
+2.8315383333  +0.0000000000  +9.2477640000  T T T
+5.6630766667  +0.0000000000  +9.2477640000  T T T
+1.4157693333  +2.4521776667  +9.2477640000  T T T
+4.2473076667  +2.4521776667  +9.2477640000  T T T
+7.0788460000  +2.4521776667  +9.2477640000  T T T
+2.8315386667  +4.9043553333  +9.2477640000  T T T
+5.6630770000  +4.9043553333  +9.2477640000  T T T
+8.4946153333  +4.9043553333  +9.2477640000  T T T
+4.2473080000  +2.4521780000 +10.5597050000  T T T
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VASP计算

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
youcanyouup
1楼2014-01-08 06:30:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

零下1℃

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
LZ你的POTCAR文件里面是不是忘记加上H原子的势函数了？？
赞一下 回复此楼
2楼2014-01-08 10:11:47
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

零下1℃

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wwm09 at 2014-01-08 22:51:14
加了，所以觉得比较奇怪...

LZ请你确认一下，你在POSCAR里面的顺序先Pt后H，与POTCAR文件里面是否一直的？如果是一直的，建议将H原子放在前面在试一次，因为我们掺杂的时候一般都是把掺杂原子放在前面，基体原子放在后面的。
赞一下 回复此楼
4楼2014-01-09 08:46:53
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wwm09 的主题更新
31/1返回列表
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 化学博士 +4 实名心动国民萌� 2024-12-17 6/300 2024-12-21 16:43 by Marrvel
[考博] 华南理工大学 “新能源交叉创新团队--主动安全”课题组招收海外联合培养博士生 +4 hubble 2024-12-20 5/250 2024-12-21 16:16 by 那片叶落
[教师之家] 40多岁的教师危机感很强啊 (金币+5) +21 farmer1999 2024-12-16 28/1400 2024-12-21 16:07 by willbuilder
[有机交流] 装柱干法上样 +3 刘松垚 2024-12-20 3/150 2024-12-21 14:37 by hanjianwei
[基金申请] 高校老师贫富差距越来越来大，有帽子的比没帽子的工资高3倍以上 +18 babu2015 2024-12-16 20/1000 2024-12-21 14:14 by lzg121
[考博] 申博的科研计划书怎么写？ +5 爱喝风的龙卷茶 2024-12-19 9/450 2024-12-21 09:47 by 爱喝风的龙卷茶
[硕博家园] “认怂了”还是“认清了”：青年博士纷纷“逃离”科研的背后…… +13 柏舟0000 2024-12-16 14/700 2024-12-21 08:36 by steven_198377
[考博] 读博的欲望达到了巅峰 +14 小丸九 2024-12-17 14/700 2024-12-21 07:27 by Skywit520
[教师之家] 你们都降薪了吗？ +10 红枣葡萄干 2024-12-18 10/500 2024-12-20 17:32 by 开心就好56
[论文投稿] 论文校稿 50+5 whale_full 2024-12-17 10/500 2024-12-20 16:39 by 北京莱茵润色
[考博] 申博找导师 +6 sepra 2024-12-15 6/300 2024-12-20 04:51 by 胖胖的大海
[教师之家] 某老师在组会上总是针对我带的学生怎么办？ +15 lice_1987 2024-12-17 23/1150 2024-12-20 04:50 by 胖胖的大海
[论文投稿] 毕业论文疑虑 20+6 风吹荷叶煞 2024-12-17 17/850 2024-12-18 17:35 by holypower
[考博] 有未就业的博士吗 +4 大发财树 2024-12-17 4/200 2024-12-18 14:13 by 她在学习
[有机交流] 求这个反应的反应条件 +6 戒骄戒躁+ 2024-12-17 6/300 2024-12-18 11:43 by diaodeng
[有机交流] 细丝状的晶体可以测单晶吗？ +5 好气好气 2024-12-16 5/250 2024-12-17 22:53 by 请让我滚去学习
[考研] 英一考研复习 +5 考研一路顺风 2024-12-14 6/300 2024-12-17 19:18 by Andy_124
[论文投稿] TNMCS投稿求助 5+3 蒋大壮hh 2024-12-15 8/400 2024-12-17 16:33 by TopEdit
[硕博家园] 大连海事大学双一流学科招收2025年博士研究生 +3 steresewan 2024-12-15 3/150 2024-12-16 00:17 by luweidong401
[硕博家园] 中国科大混合成像系统实验室HISLab招聘特任副研究员和博士后（长期有效） +3 xjtugaofei 2024-12-14 3/150 2024-12-14 22:15 by 79ep@c4m
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭