应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP计算H原子 吸附在Pt(111)表面时，最后CONTCAR 里少了H 原子
31/1返回列表
查看: 1453  |  回复: 3
查看全部回帖@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者wwm09将赠送您 5 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

wwm09

金虫 (小有名气)

[求助] VASP计算H原子 吸附在Pt(111)表面时，最后CONTCAR 里少了H 原子已有1人参与

RT，请各位帮忙看看这是怎么回事？谢谢
OUTCAR算出的能量与Pt Slab能量相同（因为H原子失踪了）。
CONTCAR 如下
Pt : Pt(111) [3x3, 4 layers]       %%（这一行的末尾出现了^M可能是问题的原因，但重新输入后情况不变）     
    1.000000000000000     
     8.4946150000000000    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     4.2473080000000000    7.3565330000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   23.1194100000000000
  36
Selective dynamics
Direct
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.3333333333333357  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.6666666666666643  0.0000000000000000  0.1000000000000014   F   F   F
  0.0000000000000000  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
  0.3333333333333357  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
  0.6666666666666643  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
  0.0000000000000000  0.6666666666666643  0.1000000000000014   F   F   F
  0.3333333333333357  0.6666666666666643  0.1000000000000014   F   F   F
  0.6666666666666643  0.6666666666666643  0.1000000000000014   F   F   F
  0.1111111111111143  0.1111111111111143  0.2000000000000028   F   F   F
  0.4444444444444429  0.1111111111111143  0.2000000000000028   F   F   F
  0.7777777777777786  0.1111111111111143  0.2000000000000028   F   F   F
  0.1111111111111143  0.4444444444444429  0.2000000000000028   F   F   F
  0.4444444444444429  0.4444444444444429  0.2000000000000028   F   F   F
  0.7777777777777786  0.4444444444444429  0.2000000000000028   F   F   F
  0.1111111111111143  0.7777777777777786  0.2000000000000028   F   F   F
  0.4444444444444429  0.7777777777777786  0.2000000000000028   F   F   F
  0.7777777777777786  0.7777777777777786  0.2000000000000028   F   F   F
  0.2222213112969953  0.2222221586930037  0.2979456023088535   T   T   T
  0.5555589726304304  0.2222202040481568  0.2979468607458601   T   T   T
  0.8888882657457644  0.2222215254295242  0.2979456008258409   T   T   T
  0.2222215526504422  0.5555568170627582  0.2979464874142188   T   T   T
  0.5555570287112902  0.5555555662755211  0.2979463665621376   T   T   T
  0.8888874742401857  0.5555564182463390  0.2979456572516460   T   T   T
  0.2222209540158847  0.8888898822528157  0.2979462539650056   T   T   T
  0.5555575642905256  0.8888883369427688  0.2979464273376182   T   T   T
  0.8888873025750039  0.8888913435780719  0.2979468240197610   T   T   T
-0.0000005869246331  0.0000001295319143  0.3977266161334645   T   T   T
  0.3333329046084976 -0.0000003446841020  0.3977275955378024   T   T   T
  0.6666677464588719  0.0000004437582833  0.3977272584943250   T   T   T
-0.0000007365677513  0.3333328967949707  0.3977266745040140   T   T   T
  0.3333341801306240  0.3333336301116413  0.3977275688338358   T   T   T
  0.6666671245051308  0.3333326688445418  0.3977267421620061   T   T   T
  0.0000001833473612  0.6666675805750582  0.3977270625181429   T   T   T
  0.3333331400601637  0.6666666154746798  0.3977270419197222   T   T   T
  0.6666667103885983  0.6666660198215224  0.3977274731344342   T   T   T

  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00

POSCAR如下：
Pt H : H-Pt(111) [3x3, 4 layers]
1.00000000000000
+8.4946150000  +0.0000000000  +0.0000000000
+4.2473080000  +7.3565330000  +0.0000000000
+0.0000000000  +0.0000000000 +23.1194100000
36 1
Selective
Cartesian
+0.0000000000  +0.0000000000  +2.3119410000  F F F
+2.8315383333  +0.0000000000  +2.3119410000  F F F
+5.6630766667  +0.0000000000  +2.3119410000  F F F
+1.4157693333  +2.4521776667  +2.3119410000  F F F
+4.2473076667  +2.4521776667  +2.3119410000  F F F
+7.0788460000  +2.4521776667  +2.3119410000  F F F
+2.8315386667  +4.9043553333  +2.3119410000  F F F
+5.6630770000  +4.9043553333  +2.3119410000  F F F
+8.4946153333  +4.9043553333  +2.3119410000  F F F
+1.4157692222  +0.8173925556  +4.6238820000  F F F
+4.2473075556  +0.8173925556  +4.6238820000  F F F
+7.0788458889  +0.8173925556  +4.6238820000  F F F
+2.8315385556  +3.2695702222  +4.6238820000  F F F
+5.6630768889  +3.2695702222  +4.6238820000  F F F
+8.4946152222  +3.2695702222  +4.6238820000  F F F
+4.2473078889  +5.7217478889  +4.6238820000  F F F
+7.0788462222  +5.7217478889  +4.6238820000  F F F
+9.9103845556  +5.7217478889  +4.6238820000  F F F
+2.8315384444  +1.6347851111  +6.9358230000  T T T
+5.6630767778  +1.6347851111  +6.9358230000  T T T
+8.4946151111  +1.6347851111  +6.9358230000  T T T
+4.2473077778  +4.0869627778  +6.9358230000  T T T
+7.0788461111  +4.0869627778  +6.9358230000  T T T
+9.9103844444  +4.0869627778  +6.9358230000  T T T
+5.6630771111  +6.5391404444  +6.9358230000  T T T
+8.4946154444  +6.5391404444  +6.9358230000  T T T
+11.3261537778  +6.5391404444  +6.9358230000  T T T
+0.0000000000  +0.0000000000  +9.2477640000  T T T
+2.8315383333  +0.0000000000  +9.2477640000  T T T
+5.6630766667  +0.0000000000  +9.2477640000  T T T
+1.4157693333  +2.4521776667  +9.2477640000  T T T
+4.2473076667  +2.4521776667  +9.2477640000  T T T
+7.0788460000  +2.4521776667  +9.2477640000  T T T
+2.8315386667  +4.9043553333  +9.2477640000  T T T
+5.6630770000  +4.9043553333  +9.2477640000  T T T
+8.4946153333  +4.9043553333  +9.2477640000  T T T
+4.2473080000  +2.4521780000 +10.5597050000  T T T
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VASP计算

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
youcanyouup
1楼2014-01-08 06:30:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

零下1℃

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
LZ你的POTCAR文件里面是不是忘记加上H原子的势函数了？？
赞一下 回复此楼
2楼2014-01-08 10:11:47
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

零下1℃

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wwm09 at 2014-01-08 22:51:14
加了，所以觉得比较奇怪...

LZ请你确认一下，你在POSCAR里面的顺序先Pt后H，与POTCAR文件里面是否一直的？如果是一直的，建议将H原子放在前面在试一次，因为我们掺杂的时候一般都是把掺杂原子放在前面，基体原子放在后面的。
赞一下 回复此楼
4楼2014-01-09 08:46:53
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wwm09 的主题更新
31/1返回列表
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 国内期刊审稿人数量 +4 新时代核动力驴 2024-11-13 6/300 2024-11-16 08:24 by pityzhou
[教师之家] 北大教授何怀宏曾如此描述他的同行 +13 zju2000 2024-11-09 13/650 2024-11-16 07:45 by 080520dxf
[教师之家] 我感觉当老师好累啊。。 +12 fairy1122 2024-11-15 12/600 2024-11-16 07:18 by licheng78
[硕博家园] 和导师撕破脸了 +17 圆满123456 2024-11-13 21/1050 2024-11-16 00:30 by ZZZemmm
[教师之家] 评正教授需要两个国家级项目，有人用子课题糊弄，结果在评审前资格公示时被举报拿下了 +22 瞬息宇宙 2024-11-12 31/1550 2024-11-15 22:02 by 潇湘之迷
[考博] 中南大学 粉末冶金国家重点实验室 陈超教授课题组拟招收 1~2位博士研究生通知 +7 中南大学-金属材 2024-11-14 18/900 2024-11-15 20:22 by 中南大学-金属材
[论文投稿] angew三个小修，返修过去已经20多天了没动静，有朋友遇到这种情况吗？ +5 迟迟未到场 2024-11-14 5/250 2024-11-15 20:16 by 秦时明月zy
[教师之家] 大学老师 +11 考研一路顺风 2024-11-13 14/700 2024-11-15 15:24 by LNP@mRNA
[基金申请] 博后资助名单出来了 +12 Shxjjxjkx 2024-11-14 14/700 2024-11-15 14:40 by fanfenggui
[基金申请] 求助 +4 Enenenene 2024-11-15 4/200 2024-11-15 09:36 by 榨菜拌青椒
[论文投稿] OE返修遇到expired +3 隔壁老王来了 2024-11-14 7/350 2024-11-14 20:46 by 隔壁老王来了
[论文投稿] 投稿系统中的通讯作者和文章中的通讯作者不一样，文章目前被录用了？ +4 babybabygo 2024-11-12 5/250 2024-11-14 19:13 by 走了002
[硕博家园] 研究生的生活该是什么样 +4 lqy0719 2024-11-14 4/200 2024-11-14 16:45 by 阿荣喝酒
[有机交流] 同一个反应回流情况不同 20+3 1853846 2024-11-12 3/150 2024-11-14 15:42 by 太阳谷
[找工作] 咨询一下江西的高校待遇，人文氛围怎么样? +5 akslis2024 2024-11-09 5/250 2024-11-14 13:53 by 啄木鸟、
[有机交流] 硫谜用双氧水氧化出现的困惑（老板说一定要用双氧水氧化做好）求指教 10+4 luowenwu 2024-11-10 15/750 2024-11-14 10:52 by luolinfeng
[基金申请] 博后面上出结果了 +5 wl87925139 2024-11-14 5/250 2024-11-14 10:26 by kingmax18996
[论文投稿] 要不要撤稿另投 10+4 wangzhesd 2024-11-09 8/400 2024-11-14 09:09 by LIU_V
[硕博家园] 如何看清华北大硕博的毕业论文 +6 2025lucky 2024-11-10 6/300 2024-11-12 22:46 by 楚扬长流
[硕博家园] 同步辐射 +4 小张要加油努力 2024-11-10 7/350 2024-11-11 13:47 by mpdfwxgui
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭