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upc穆宁

新虫 (小有名气)

[求助] 体系中有很多水分子,如何用rattle命令限制水分子的类型和键长键角 已有1人参与

我使用的是MS软件,建了一个的体系,其中有很多的水分子。现在我需要限制水分子的类型和键长与键角,具体怎么操作呢?
我曾经看到过这个Materials Studio软件常见问题与解答(http://www.docin.com/p-205857093.html)中有这个问题,但是自己愚笨看不是很懂,也看过软件中的help。在这里请问各位专家,对于这种问题需要怎么做?
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upc穆宁

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cg陈 at 2013-12-26 13:04:42
限制水分子的类型 MS貌似不能直接定义
限制水分子的键长和键角 MS还是很好实现的
比如某个水分子模型,你画好键角键长,然后用modify的constraints选项 调用measurement工具
就可以限制键长键角和二面角

谢谢回复。你说的这个我知道,好像是要把所有的水分子键长、键角都选中吧,很麻烦。我看过help文件,里面有个rattle关键词,可以限制水分子的类型和结构,这是help中的截图,你看看有什么帮助吗
体系中有很多水分子,如何用rattle命令限制水分子的类型和键长键角
H0L4CK5ZQSSKEP1TWA($Y8L.jpg

3楼2013-12-26 18:39:03
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查看全部 15 个回答

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
限制水分子的类型 MS貌似不能直接定义
限制水分子的键长和键角 MS还是很好实现的
比如某个水分子模型,你画好键角键长,然后用modify的constraints选项 调用measurement工具
就可以限制键长键角和二面角
2楼2013-12-26 13:04:42
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upc穆宁

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cg陈 at 2013-12-26 13:04:42
限制水分子的类型 MS貌似不能直接定义
限制水分子的键长和键角 MS还是很好实现的
比如某个水分子模型,你画好键角键长,然后用modify的constraints选项 调用measurement工具
就可以限制键长键角和二面角

但是我没看懂,所以来求助
4楼2013-12-26 18:39:59
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upc穆宁

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by cg陈 at 2013-12-29 23:09:28
比如你画好水分子 比如在discover的dynamics中选择file 然后savefile
  紧接着你找到该分子的目标文件夹(在硬盘上),里面就有个.car文件 你用editplus打开编辑
剩下就是:
    关于水分子的部分按照如下方式 ...

谢谢,需要一个水分子一个水分子的操作码?
6楼2013-12-30 10:47:46
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