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酶切问题
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风吹我已散
木虫
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[交流]
酶切问题
在19T上连了一个目的片段(大概1.6K),挑单克隆菌落培养,分别pcr和酶切验证目的片段在19T上的插入方向。根据我的目的基因的序列,选择了xbal酶切,该酶切位点在我的目的片段大概1.2K左右的位置上,也就是说如果是正向插入的话,酶切下来应该是3.9K和400bp的条带;反向插入的应该是1.2K和3.1k左右的条带。通过载体上的引物和我扩目的片段的引物pcr验证出了正向和反向插入(有正负对照);但是酶切只能验证反向插入的(有1.2K和3.1k左右的条带),而正向插入的无400bp的条带。这个怎么解释?胶我试过1.5%和1.2%的,都没有。
求帮助。
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1楼
2013-11-22 10:34:19
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huahu3600
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
PCR假阳性率很高
我更愿意相信酶切结果
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7楼
2013-11-22 16:18:47
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cicelyzh
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★ ★ ★ ★
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风吹我已散: 金币+1
2013-11-22 13:08:18
gyesang: 金币+2, 鼓励交流!
2013-11-22 16:23:44
酶切出来的小片段在胶上比较暗。增加点样量,应该可以看到的。
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2楼
2013-11-22 11:22:00
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木虫
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2楼
:
Originally posted by
cicelyzh
at 2013-11-22 11:22:00
酶切出来的小片段在胶上比较暗。增加点样量,应该可以看到的。
我试试看哈。
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3楼
2013-11-22 13:08:31
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zh10246
铁杆木虫
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★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你的目的是什么,表达还是测序,最好的方法就是测序
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4楼
2013-11-22 14:09:43
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