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gasam金虫 (小有名气)
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分子动力学能量守恒的相关问题 已有5人参与
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小弟最近在编分子动力学的程序，在测试NVE能量守恒的时候出现偏移，想咨询下各位专家，这个偏移造成的原因？ 自己考虑会不会是因为potential用了cutoff后，能量有误差？希望大家能指点下小弟。。。。。 用了cutoff后能量是会有点下降？还是上升？还是不变？ 如果不变的话，那个偏移会是什么造成的？我确认了力的式子之类的，都没发现错误。。。。 |
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2楼2013-11-22 02:15:52
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偏差略大，按理说数值误差没有这么大。如果你用的是可变步长，可以尝试增加积分精度。你总的时间是多长？如果增加积分精度后还在这个数量级的话，应该就是截断造成的。我用大概25000项求和展开的势能计算2731858步之后的误差大概是你的十分之一左右。不过因为还要积分在个别点附近趋于无穷大的耦合项，我的步长很小，这么多步也只走了50ns，所以需要和你的时间尺度对比下。你可以尝试先不做截断进行计算，排除有bug的可能。 你是不是哪里不小心用单精度数了？ |
13楼2013-11-22 15:19:36
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