| 查看: 1276 | 回复: 0 | ||||
tim562944200金虫 (小有名气)
|
[求助]
MS建模msi2lmp转化得到data文件,一些疑问
|
|
用MS建模后用msi2lmp工具转化得到了lammps 的data文件,产生了一些疑问,data文件中显示了 3 atom types 4 bond types 7 angle types 7 dihedral types 然后下边有这些的具体参数, Pair Coeffs 1 0.0389999952 3.8754094636 2 0.0389999952 3.8754094636 3 0.0380000011 2.4499714540 Bond Coeffs 1 322.7158 1.5260 2 340.6175 1.1050 3 340.6175 1.1050 4 322.7158 1.5260 Angle Coeffs 1 44.4000 110.0000 2 39.5000 106.4000 3 44.4000 110.0000 4 46.6000 110.5000 5 39.5000 106.4000 6 44.4000 110.0000 7 46.6000 110.5000 Dihedral Coeffs 1 0.1581 1 3 2 0.1581 1 3 3 0.1581 1 3 4 0.1581 1 3 5 0.1581 1 3 6 0.1581 1 3 7 0.1581 1 3 Atoms 1 1 1 -0.159000 6.997875366 11.586652204 54.557198467 0 0 0 2 1 2 -0.106000 7.955281715 11.850127996 53.393961800 0 0 0 3 1 3 0.053000 7.388256974 10.793986488 55.214826641 0 0 0 4 1 3 0.053000 6.010861410 11.265345244 54.188631170 0 0 0 我想搞清楚这些参数具体定义什么参数,阅读了lammps manual说是需要根据in文件中angle_coeff等相关命令的定义来确定,可是我转化为data文件就已经有了这些参数,并没有写in文件,所以我不清楚的是data文件body中这些参数具体指的什么,举例: Atoms 1 1 1 -0.159000 6.997875366 11.586652204 54.557198467 0 0 0 原子ID ? 原子类型 ? x坐标 y坐标 z坐标 nx ny nz Pair Coeffs 1 0.0389999952 3.8754094636 ? ? |
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
分子动力学 |
» 猜你喜欢
存款400万可以在学校里躺平吗
已经有7人回复
基金委咋了?2026年的指南还没有出来?
已经有10人回复
拟解决的关键科学问题还要不要写
已经有6人回复
基金申报
已经有6人回复
推荐一本书
已经有13人回复
国自然申请面上模板最新2026版出了吗?
已经有17人回复
纳米粒子粒径的测量
已经有8人回复
疑惑?
已经有5人回复
计算机、0854电子信息(085401-058412)调剂
已经有5人回复
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有5人回复
找到一些相关的精华帖子,希望有用哦~
MS建立Co3O4模型
已经有25人回复
【求助】关于LAMMPS建模
已经有9人回复
MS修改键长,MS画石墨烯,MS文件导入LAMMPS
已经有3人回复
MS无法导出任何格式的文件
已经有4人回复
ms构建好的模型转化为lammps data文件
已经有5人回复
lammps中tools的lmp2VMD
已经有11人回复
ms导出lammps的data文件的亲身经验,希望能帮上各位一点
已经有306人回复
ms模型导入lammps
已经有8人回复
lammps data file中水的H,O排列
已经有4人回复
MS安装后的模型不能转动等问题
已经有7人回复
【讨论】想学lammps是否应该先学习C++
已经有28人回复
【求助】将MS数据文件转化成lammps data
已经有25人回复
【求助】MS建模导入lammps问题求救
已经有14人回复
科研从小木虫开始,人人为我,我为人人











回复此楼

点击这里搜索更多相关资源