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tim562944200金虫 (小有名气)
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[求助]
MS建模msi2lmp转化得到data文件，一些疑问
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用MS建模后用msi2lmp工具转化得到了lammps 的data文件，产生了一些疑问，data文件中显示了 3 atom types 4 bond types 7 angle types 7 dihedral types 然后下边有这些的具体参数， Pair Coeffs 1 0.0389999952 3.8754094636 2 0.0389999952 3.8754094636 3 0.0380000011 2.4499714540 Bond Coeffs 1 322.7158 1.5260 2 340.6175 1.1050 3 340.6175 1.1050 4 322.7158 1.5260 Angle Coeffs 1 44.4000 110.0000 2 39.5000 106.4000 3 44.4000 110.0000 4 46.6000 110.5000 5 39.5000 106.4000 6 44.4000 110.0000 7 46.6000 110.5000 Dihedral Coeffs 1 0.1581 1 3 2 0.1581 1 3 3 0.1581 1 3 4 0.1581 1 3 5 0.1581 1 3 6 0.1581 1 3 7 0.1581 1 3 Atoms 1 1 1 -0.159000 6.997875366 11.586652204 54.557198467 0 0 0 2 1 2 -0.106000 7.955281715 11.850127996 53.393961800 0 0 0 3 1 3 0.053000 7.388256974 10.793986488 55.214826641 0 0 0 4 1 3 0.053000 6.010861410 11.265345244 54.188631170 0 0 0 我想搞清楚这些参数具体定义什么参数，阅读了lammps manual说是需要根据in文件中angle_coeff等相关命令的定义来确定，可是我转化为data文件就已经有了这些参数，并没有写in文件，所以我不清楚的是data文件body中这些参数具体指的什么，举例： Atoms 1 1 1 -0.159000 6.997875366 11.586652204 54.557198467 0 0 0 原子ID ？ 原子类型 ？ x坐标 y坐标 z坐标 nx ny nz Pair Coeffs 1 0.0389999952 3.8754094636 ? ? |
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