| 查看: 1357 | 回复: 0 | |||
tim562944200金虫 (小有名气)
|
[求助]
MS建模msi2lmp转化得到data文件，一些疑问
|
|
用MS建模后用msi2lmp工具转化得到了lammps 的data文件，产生了一些疑问，data文件中显示了 3 atom types 4 bond types 7 angle types 7 dihedral types 然后下边有这些的具体参数， Pair Coeffs 1 0.0389999952 3.8754094636 2 0.0389999952 3.8754094636 3 0.0380000011 2.4499714540 Bond Coeffs 1 322.7158 1.5260 2 340.6175 1.1050 3 340.6175 1.1050 4 322.7158 1.5260 Angle Coeffs 1 44.4000 110.0000 2 39.5000 106.4000 3 44.4000 110.0000 4 46.6000 110.5000 5 39.5000 106.4000 6 44.4000 110.0000 7 46.6000 110.5000 Dihedral Coeffs 1 0.1581 1 3 2 0.1581 1 3 3 0.1581 1 3 4 0.1581 1 3 5 0.1581 1 3 6 0.1581 1 3 7 0.1581 1 3 Atoms 1 1 1 -0.159000 6.997875366 11.586652204 54.557198467 0 0 0 2 1 2 -0.106000 7.955281715 11.850127996 53.393961800 0 0 0 3 1 3 0.053000 7.388256974 10.793986488 55.214826641 0 0 0 4 1 3 0.053000 6.010861410 11.265345244 54.188631170 0 0 0 我想搞清楚这些参数具体定义什么参数，阅读了lammps manual说是需要根据in文件中angle_coeff等相关命令的定义来确定，可是我转化为data文件就已经有了这些参数，并没有写in文件，所以我不清楚的是data文件body中这些参数具体指的什么，举例： Atoms 1 1 1 -0.159000 6.997875366 11.586652204 54.557198467 0 0 0 原子ID ？ 原子类型 ？ x坐标 y坐标 z坐标 nx ny nz Pair Coeffs 1 0.0389999952 3.8754094636 ? ? |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子动力学 |
» 猜你喜欢
面上合作单位盖章
已经有8人回复
-
面上函评意见出来了，像什么等级？
已经有15人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有14人回复
-
小白求助 投论文要求的highlights应该如何写
已经有4人回复
-
麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上）
已经有12人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有6人回复
-
国社科又开始会评了，不知道这次命运如何
已经有11人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有19人回复
-
基金未中，这种答复是模板吗？
已经有7人回复
-
哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识
已经有7人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
MS建立Co3O4模型
已经有25人回复
- 【求助】关于LAMMPS建模
已经有9人回复
- MS修改键长，MS画石墨烯，MS文件导入LAMMPS
已经有3人回复
- MS无法导出任何格式的文件
已经有4人回复
- ms构建好的模型转化为lammps data文件
已经有5人回复
- lammps中tools的lmp2VMD
已经有11人回复
- ms导出lammps的data文件的亲身经验，希望能帮上各位一点
已经有306人回复
- ms模型导入lammps
已经有8人回复
- lammps data file中水的H，O排列
已经有4人回复
- MS安装后的模型不能转动等问题
已经有7人回复
- 【讨论】想学lammps是否应该先学习C++
已经有28人回复
- 【求助】将MS数据文件转化成lammps data
已经有25人回复
- 【求助】MS建模导入lammps问题求救
已经有14人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
5
投票: