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萝莉胖

铜虫 (小有名气)

[交流] BSA做考马斯亮蓝标准曲线的问题已有6人参与

请问大家,用BSA做考马斯亮蓝标准曲线来测定目的蛋白浓度,如果目的蛋白的分子量和BSA差很多的时候,BSA标准曲线是否能用?还是需要用与目的蛋白差不多的蛋白来做标准曲线?
详细:
1. 我有一目的蛋白,叫细菌视紫红质(bacteriorhodopsin,BR),分子量为26kD,其中Arg、Trp、Phe和Tyr这四个残基一共有38个。
背景:
1) 细菌视紫红质(简称BR),除了在280nm有吸收峰外,在558nm处也有吸收峰(暗适应态),因为此蛋白内部有一个发色团。
2)BR的浓度计算,一般是用在558nm的摩尔消光系数ε558=53000M-1cm-1来计算。

2. 用摩尔消光系数得到的BR浓度vs用考马斯亮蓝法(BSA标曲)得到的浓度
1)我配制一定浓度的BR溶液,测得OD558=0.396,用摩尔消光系数计算得浓度为194ug/ml
2)用BSA制备标曲曲线,步骤如下:
称取2.06mg BSA溶于20ml去离子水,母液浓度为0.103mg/ml,与染料作用10分钟,具体参数和标准曲线见图。
用此标准曲线,测定上述BR溶液浓度,取1ml待测液,与4ml考马斯染液作用10分钟,取3ml测OD595=0.474,计算得到此蛋白浓度为为49.69ug/ml
用两种方法测定的蛋白浓度相差约四倍。

疑问:1.为什么会有这样的差异,是因为BSA和BR这两种蛋白的分子量和所含的氨基酸成分不同造成的吗,还是因为BR本身在558nm有吸收峰而造成的影响?
      2. 我有另一个目的蛋白,和BR一样也是细菌类视紫红质,在550nm有特征吸收峰,测定这个蛋白,我是用BSA还是BR来做标准曲线?

谢谢,如果有不清楚的地方,请回帖问我。
BSA做考马斯亮蓝标准曲线的问题
BR光谱扫描.jpg


BSA做考马斯亮蓝标准曲线的问题-1
BSA参数.jpg


BSA做考马斯亮蓝标准曲线的问题-2
BSA标曲.jpg
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
竟然是用BSA做标准物,那么作标曲,以及测你的样品。
保证体系不变,波长不变就可以了。

不要考虑你样品的最大吸收峰波长了。
Thank-you,so-blue.
2楼2013-11-08 13:37:09
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不好意思,题目没看清楚,
自己科普了下,
(1)测定条件跟查到的蛋白质的摩尔浓度所用的溶液条件是否一致?
(2)测定时样品的光程是否为1cm?
其他我也看不出破绽。
Thank-you,so-blue.
3楼2013-11-08 14:02:30
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小熊笨笨run

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你用BSA标曲,表格中蛋白浓度都要相应乘以5吧,测得的蛋白浓度是248.45ug/ml,与用摩尔消光系数计算得浓度为194ug/ml有差距,但不同方法间不可能相同吧。
4楼2013-11-08 14:48:40
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weebug

版主 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用280nm 测看,因为你的蛋白含有Arg、Trp、Phe和Tyr氨基酸。
天蓝蓝兮日头晒
5楼2013-11-08 14:53:37
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萝莉胖

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 小熊笨笨run at 2013-11-08 14:48:40
你用BSA标曲,表格中蛋白浓度都要相应乘以5吧,测得的蛋白浓度是248.45ug/ml,与用摩尔消光系数计算得浓度为194ug/ml有差距,但不同方法间不可能相同吧。

已经乘以5了,此外,我想到一点,我的目的蛋白是膜蛋白,测浓度时的状态是蛋白-磷脂复合物,这样是否影响此体系测蛋白浓度的准确性
我是自己的神
6楼2013-11-12 09:43:25
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萝莉胖

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by weebug at 2013-11-08 14:53:37
用280nm 测看,因为你的蛋白含有Arg、Trp、Phe和Tyr氨基酸。

用280测我这目的蛋白浓度,测不准。我的蛋白是一种嗜盐杆菌膜上的膜蛋白,蛋白提取是通过蔗糖梯度离心来纯化的。测浓度时,蛋白的状态是磷脂-蛋白复合物。我想,这一点是不是造成大误差的原因。
我是自己的神
7楼2013-11-12 09:46:46
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萝莉胖

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by susizheng at 2013-11-08 14:02:30
不好意思,题目没看清楚,
自己科普了下,
(1)测定条件跟查到的蛋白质的摩尔浓度所用的溶液条件是否一致?
(2)测定时样品的光程是否为1cm?
其他我也看不出破绽。

感谢回复,光程是1cm,至于溶液条件,我去查查最初的原始文献。
我是自己的神
8楼2013-11-12 09:48:16
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萝莉胖

铜虫 (小有名气)

补充一条件,目的蛋白BR,是一种位于嗜盐杆菌膜上的七跨膜蛋白,天然状态下,在膜上形成稳定的3聚体蛋白-磷脂复合体。纯化此蛋白是用蔗糖梯度离心法,最后得到的目的蛋白样品是“BR三聚体-磷脂”复合物,我想是否鉴于它是膜蛋白,而且与磷脂形成复合物,所以影响了样品与考马斯亮蓝的作用,使得用考马斯亮蓝法测定的浓度偏小。 用558nm的摩尔消光系数法测定的浓度是绝对正确的,因为原理是通过测定它的配体“视黄醛”来确定的,蛋白和配体以摩尔比1:1结合。确定上述问题的目的是,为了测定我的另一个与BR性质相近的蛋白。
PS:功能区的摩尔消光系数比较难测定。
我是自己的神
9楼2013-11-12 09:59:38
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小熊笨笨run

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by 萝莉胖 at 2013-11-12 09:43:25
已经乘以5了,此外,我想到一点,我的目的蛋白是膜蛋白,测浓度时的状态是蛋白-磷脂复合物,这样是否影响此体系测蛋白浓度的准确性...

你好!可以展示下你用BSA标曲测所得的原始数据吗?我现在按你所提供的得到的也不是你所说的数值,是不是你取1ml的待测液也进行了一定的稀释?你想到的蛋白状态是否影响测浓度的准确性,这点我没考虑过,但觉得不是。
10楼2013-11-12 18:32:36
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