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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求将多条核酸序列转化为氨基酸序列的方法或软件使用过程
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ivxy

金虫 (正式写手)

[求助] 求将多条核酸序列转化为氨基酸序列的方法或软件使用过程

求将多条核酸序列转化为氨基酸序列的方法或软件使用过程
现在有个转录组数据，想转化为氨基酸序列；
如何进行？
谢谢大家
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1楼 2013-11-06 11:08:14
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沙门小rna

金虫 (正式写手)
★
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香。分子生物期待你更多精彩 。 2013-11-06 12:11:19
我的方法是你把序列输入到oligo6里面。然后你点edit。然后你选择protein，就完成了转换。然后再弄下一个。希望有助！当然你可以去网上转换。网址http://web.expasy.org/protparam/ ... dle\" border=\"0\">祝你成功
求将多条核酸序列转化为氨基酸序列的方法或软件使用过程
序列输入，点edit


求将多条核酸序列转化为氨基酸序列的方法或软件使用过程-1
点protein搞定！
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ivxy
应助之星就是我~没错。你没有看错~
2楼2013-11-06 11:39:26
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沙门小rna

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
ivxy: 金币+5, ★有帮助, 一次只能转换一条 2013-11-06 17:17:11
引用回帖:
2楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-06 11:39:26
我的方法是你把序列输入到oligo6里面。然后你点edit。然后你选择protein，就完成了转换。然后再弄下一个。希望有助！当然你可以去网上转换。网址http://web.expasy.org/protparam/祝你成功

序列输入， ...

网址是
http://web.expasy.org/protparam/
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应助之星就是我~没错。你没有看错~
3楼2013-11-06 11:40:28
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ivxy

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-06 11:39:26
我的方法是你把序列输入到oligo6里面。然后你点edit。然后你选择protein，就完成了转换。然后再弄下一个。希望有助！当然你可以去网上转换。网址http://web.expasy.org/protparam/祝你成功

序列输入， ...

若有上千条转录组，就不好一个一个处理了吧
谢谢！
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4楼2013-11-06 13:11:34
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沙门小rna

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
ivxy: 金币+5, ★有帮助, 看过了，没明白 2013-11-06 17:14:59
引用回帖:
4楼: Originally posted by ivxy at 2013-11-06 13:11:34
若有上千条转录组，就不好一个一个处理了吧
谢谢！...

http://muchong.com/html/201210/5100847.html看看这个。一样的问题，希望对你有帮助~
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应助之星就是我~没错。你没有看错~
5楼2013-11-06 13:21:37
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niil

金虫 (正式写手)
找个会perl或者python编程的人帮你吧。你的数据量太大，一般的软件估计不好实现。
而且还要根据你的数据的实际情况去编写程序。
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Stop fighting,let it flow.
6楼2013-11-06 16:11:32
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不喝咖啡

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
ivxy: 金币+5, ★有帮助, 用了mega，但没成功，你能解释一下操作过程吗？ 2013-11-06 17:16:05
你可以用mega试一下，构建进化树用的软件，可以转换多条序列的核酸序列成氨基酸序列，但是好像要是fasta格式的文件才可以，而且你要自己修改好序列，它不会帮你找起始密码子，直接从头翻译到尾
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7楼2013-11-06 16:39:48
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