24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2319  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

jbj1001

银虫 (小有名气)

[求助] 诡异的qPCR结果,请大家帮忙解释下

样品是小鼠的二细胞胚胎,做GAPDH的标准曲线,出现的结果让我很困惑。用的是ABI的Arcturus® PicoPure™ RNA Isolation Kit,号称能够提取单个细胞的RNA,但由于由于收集的胚胎不多,所以提取的RNA的量还是比较少的,大约有40多ng在10ul反转录体系里面。今天做标准曲线时取了其中的3.5ul先稀释10倍到35ul,然后依次按照5倍的梯度稀释。实时定量PCR用的试剂盒是TAKARA的DRR820,机器是ABI7500。

看完附图后,我的问题是
1.        为什么625、125倍浓度的扩增曲线在一开始就出现峰,而ct值也分别只有15、25左右?
2.        我以5倍浓度的梯度稀释,为什么ct值会相差10左右?
3.        忽略掉最低两个浓度后的标准曲线slope:-12.24,Y-inter:55.271,R2:0.998,EFF%:17.551,这正常吗?
诡异的qPCR结果,请大家帮忙解释下
标准曲线.png


诡异的qPCR结果,请大家帮忙解释下-1
最后两个浓度去掉以后的标曲.png


诡异的qPCR结果,请大家帮忙解释下-2
625倍浓度(最高浓度)的扩增曲线.png


诡异的qPCR结果,请大家帮忙解释下-3
125倍浓度的扩增曲线.png


诡异的qPCR结果,请大家帮忙解释下-4
25倍浓度的扩增曲线.png


诡异的qPCR结果,请大家帮忙解释下-5
5倍浓度的扩增曲线.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

沙门小rna

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jbj1001 at 2013-11-07 10:03:11
产物没有跑电泳,但是溶解曲线是单峰。换了牛细胞的样品做的GAPDH标准曲线很好。这个是小鼠的GAPDH,还做了小鼠的另外一个基因的,也是和这个一样的。...

首先无语的结果
然后。。。。。光从现象上解释就是你一开始就有很强的荧光强度,感觉后面ct阈值相似了。是不是样本没冰上弄啊?还是什么别的原因,光看图分析是无解。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

应助之星就是我~没错。你没有看错~
5楼2013-11-07 10:33:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

匿名

用户注销 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jbj1001: 金币+10, 有帮助 2013-11-05 00:15:34
本帖仅楼主可见
2楼2013-11-05 00:13:13
已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

沙门小rna

金虫 (正式写手)

扩增效率怎么那么低呢。你体系有问题啊。ct一般18-30之间比较好。太高太低都不行。效率最好是100%但是不可能达到。但是17%太低了。刚开始就达到峰值我估摸是你非特性扩增吧。是不是引物么有选好。建议你把产物跑一个电泳看看条带是否是你要的。~
应助之星就是我~没错。你没有看错~
3楼2013-11-05 14:42:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jbj1001

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-05 14:42:41
扩增效率怎么那么低呢。你体系有问题啊。ct一般18-30之间比较好。太高太低都不行。效率最好是100%但是不可能达到。但是17%太低了。刚开始就达到峰值我估摸是你非特性扩增吧。是不是引物么有选好。建议你把产物跑一个 ...

产物没有跑电泳,但是溶解曲线是单峰。换了牛细胞的样品做的GAPDH标准曲线很好。这个是小鼠的GAPDH,还做了小鼠的另外一个基因的,也是和这个一样的。
4楼2013-11-07 10:03:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料工程302分求调剂 +10 zyx上岸! 2026-04-04 10/500 2026-04-06 22:49 by chenzhimin
[考研] 273求调剂 +20 麦小叮当 2026-04-06 23/1150 2026-04-06 22:22 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿北京化工大学,初试成绩350求调剂 +9 沿岸?贝壳 2026-04-04 14/700 2026-04-05 01:09 by 沿岸?贝壳
[考研] 专硕310求调剂 +5 捞捞我…. 2026-04-04 6/300 2026-04-04 23:33 by barlinike
[考研] 278求调剂 +14 范婷娜 2026-04-04 15/750 2026-04-04 22:15 by lqwchd
[考研] 求生物学调剂 +14 15172915737 2026-04-01 14/700 2026-04-04 20:13 by babysonlkd
[考研] 材料383求调剂 +5 郭阳阳阳成 2026-04-04 5/250 2026-04-04 19:06 by dongzh2009
[考研] 309求调剂 +4 快乐的小白鸽 2026-04-04 5/250 2026-04-04 15:55 by cql1109
[考研] 一志愿0817化学工程与技术,求调剂 +24 我不是只因 2026-04-02 28/1400 2026-04-04 15:15 by dongzh2009
[考研] 土木304求调剂 +4 兔突突突, 2026-03-31 4/200 2026-04-04 13:34 by 1753564080
[考研] 294求调剂 +6 Grey_Ey 2026-04-03 6/300 2026-04-03 20:46 by 欣喜777
[考研] 调剂 +5 asdasdassda 2026-04-03 6/300 2026-04-03 20:27 by 岸上的一条鱼
[考研] 五邑大学土木工程招调剂生2026 +3 wyutj 2026-03-31 4/200 2026-04-03 18:21 by zengxj_7201
[考研] 315求调剂 +6 顺理成张 2026-04-03 8/400 2026-04-03 14:04 by 百灵童888
[考研] 0856材料与化工调剂,339 +14 10213207 2026-03-31 14/700 2026-04-02 21:01 by 1104338198
[考研] 354求调剂 +4 lxb598 2026-03-31 5/250 2026-04-02 09:55 by Jaylen.
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-04-02 4/200 2026-04-02 09:52 by yulian1987
[考研] 286求调剂 +5 Sa67890. 2026-04-01 7/350 2026-04-01 19:50 by 6781022
[考研] 调剂申请 +8 张张张张zy 2026-03-31 9/450 2026-04-01 08:29 by zjbkx
[考研] 085601英二数二求调剂 总分325 +4 余航航 2026-03-31 4/200 2026-03-31 17:38 by 唐沐儿
信息提示
请填处理意见