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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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leanner

铁虫 (初入文坛)

[求助] 用DMol3做过渡态,出现问题,求助! 已有1人参与

新手一枚,在用DMol3做过渡态时,反应物为碳管+解离的氧原子,生成物为吸附后的结构,想做这个反应的过渡态,各个原子已经匹配好,DMol3参数也已经设置好,点Run之后提示:The document does not contain a valid trajectory。
求助该如何解决?
用DMol3做过渡态,出现问题,求助!
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泡花alkali

新虫 (小有名气)

哥们。问题解决了么?我也遇到这个问题了搜不到答案
2楼2019-04-09 14:32:58
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by 泡花alkali at 2019-04-09 14:32:58
哥们。问题解决了么?我也遇到这个问题了搜不到答案

如果要走LST/QST过程的话应该要先在tools里面的reaction preview选择优化好的反应物、产物对对应的原子进行匹配,然后生成(插值得到)的轨迹,然后在激活轨迹文件的情况下运行TS search任务。

如果反应很简单,你可以直接手工搭建或对某个自由度做约束进行优化得到近似的过渡态,然后计算活性区域的partial Hessian直接进行TS opt而不必去做LST/QST。当然这需要足够的经验和技巧。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
3楼2019-04-10 00:04:00
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