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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 序列相似性问题
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无花草

新虫 (初入文坛)

[求助] 序列相似性问题

大家好，我用同一对引物，扩增的同一样品，测得的序列相似性差的很，见图，序列比对很乱，相似很低，麻烦大家帮忙分析原因，及怎么解决?
序列相似性问题
4.jpg


序列相似性问题-1
3.jpg
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好好做实验，毕业找份好工作！
1楼 2013-10-15 10:59:08
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libhlk

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
无花草: 金币+2, ★有帮助 2013-10-23 16:52:32
有可能提取的样品DNA不纯，可能有其他DNA，建议测定DNA纯度，再跑个特异引物PCR扩增
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2楼2013-10-20 21:31:40
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无花草

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by libhlk at 2013-10-20 21:31:40
有可能提取的样品DNA不纯，可能有其他DNA，建议测定DNA纯度，再跑个特异引物PCR扩增

我是用试剂盒提取的RNA，然后反转录成cDNA为模板做的PCR。
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好好做实验，毕业找份好工作！
3楼2013-10-23 16:53:16
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David勇

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-10-29 18:16:02
是不是接到载体上测序的，出来反向互补的序列。或者你有没有将产物跑胶，看是否有非特异性带。
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4楼2013-10-24 09:38:17
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