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实时荧光定量pcr,cDNA的加入量会影响结果的准确度吗?
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| 大家好,最近一直做荧光定量pcr,20ul体系中3ug的rna反转录得到的cDNA,取4ul作为pcr的模板,10ul EvaGreen,4ul引物,2ulRNas水,这个体系可以得到挺好的结果,但是溶解曲线的温度在77°,不知道是不是引物二聚体,而且我觉得模板的量加的太多了,实验不能重复,一次就用光了,不知道是不是应该稀释一下? |
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taccycle
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【答案】应助回帖
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1、把cDNA稀释10倍的话其Ct值才增大3.2左右,只要你的Ct最后能落在33以内机器检测的准确度就没有什么影响,所以只要你目的基因的Ct值在30以内,你就可以大胆放心的稀释,你可以先稀释5倍测试一下。 2、检测有没有引物二聚体你可以配一个3%的琼脂糖胶把PCR产物跑一个电泳,选择一个合适的Marker,比如DL500,引物二聚体一般都小于100bp,如果只有一条size正确的条带,那就说明没有引物二聚体 3、Tm值不能说明这个峰是不是引物二聚体,我的目的条带的Tm有的只有75℃ 4、模板用量不会影响定量结果(只要不是那种极端用量),这是理论上决定的,就算有影响也是微乎其微的 |

13楼2013-10-16 16:24:57
cicelyzh
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2楼2013-10-14 22:31:01

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