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王之御魂

木虫 (小有名气)

[求助] 真菌菌丝体提取DNA问题

最近在提真菌的DNA准备测序,提了几次DNA纯度可以,PCR后条带单一,但是送了3次样都测不出结果,想请教前辈们大概选取什么时候的菌丝体来提DNA最好?我在做的这真菌一般第二天摇瓶中就形成很多菌丝体(一般在培养第四、五天收集菌丝体提DNA)
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任_强

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
王之御魂: 金币+4, ★★★很有帮助 2013-10-09 08:38:28
一般选择菌体生长旺盛的时期,也就是指数生长期。你选四五天的可能有些晚。但你说你纯度可以、PCR条带单一,应该是提出来了。应该不是菌龄的问题吧。你再好好找找其他的原因。
微生物行业的初学者,望大牛们不吝赐教
3楼2013-10-09 08:18:17
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王之御魂

木虫 (小有名气)

是不是菌丝体长过头了
2楼2013-10-09 08:00:24
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王之御魂

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 任_强 at 2013-10-09 08:18:17
一般选择菌体生长旺盛的时期,也就是指数生长期。你选四五天的可能有些晚。但你说你纯度可以、PCR条带单一,应该是提出来了。应该不是菌龄的问题吧。你再好好找找其他的原因。

我看了下过滤收集菌丝体用的纱布和冲洗的蒸馏水都要无菌处理,这些影响大吗?
4楼2013-10-09 08:39:45
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任_强

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
王之御魂: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-10-14 09:17:08
做实验就要按照实验要求去做,不然你不知道哪一步出错。我提真菌RNA的时候取出来的菌体进行过滤和洗涤时也没考虑杂菌的污染问题。不过现在想起来,觉得这个问题挺严重的。如果在提出的菌体中混有杂菌,你不就相当于把杂菌的DNA也提出来了吗?
微生物行业的初学者,望大牛们不吝赐教
5楼2013-10-09 09:55:44
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