24小时热门版块排行榜    

查看: 2116  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

coldplay5

新虫 (初入文坛)

[求助] 筛到一个菌,如何做进化树?

鉴定出来的是26s rDNA,是一株酵母菌,如何做进化树啊?现在只有序列,如何从这一步开始,做到进化树。求大神帮助,步骤越详细越好啊!对这方面一窍不通
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangdayuan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-09-27 15:10:30
引用回帖:
3楼: Originally posted by coldplay5 at 2013-09-26 18:20:20
做出来很不好看,同源性太高?...

跟它在一只的有好几个吗,软件的参数设计都正常的吗,还有就是你在将菌株序列放到mega软件的比对的时候,有没有把前面的没有的剪切对齐的啊,应该可以应该可以做到跟一个菌在一个小分支上的
顺其自然,为所当为
4楼2013-09-27 14:23:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

yangdayuan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-09-26 15:20:15
把你的序列放到NCBI或者韩国的一个网站上对比,会有很多跟你的鉴定出来的相似的菌株序列出来,把这些考到进化树分析软件(MEGA)上,按照软件的使用程序来做,进化树就出来了。我还是好几年前做菌株鉴定的时候做过,现在只记得大概程序,
顺其自然,为所当为
2楼2013-09-26 15:04:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

coldplay5

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yangdayuan at 2013-09-26 15:04:27
把你的序列放到NCBI或者韩国的一个网站上对比,会有很多跟你的鉴定出来的相似的菌株序列出来,把这些考到进化树分析软件(MEGA)上,按照软件的使用程序来做,进化树就出来了。我还是好几年前做菌株鉴定的时候做过, ...

做出来很不好看,同源性太高?
3楼2013-09-26 18:20:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 06:57 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 06:55 by ZPa0EcMwuECS
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 06:46 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 06:22 by ZPa0EcMwuECS
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 06:13 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-30 05:48 by winsaint
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 11/550 2026-08-30 05:40 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 03:26 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 3/150 2026-08-30 02:33 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-30 00:52 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 面上意见出来了 +8 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 16/800 2026-08-29 20:45 by 黄鸟于飞Chao
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +9 苏东坡二世 2026-08-23 9/450 2026-08-29 14:41 by hustersqt
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 9/450 2026-08-29 09:59 by jklily
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
信息提示
请填处理意见