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coldplay5

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[求助] 筛到一个菌，如何做进化树？

鉴定出来的是26s rDNA，是一株酵母菌，如何做进化树啊？现在只有序列，如何从这一步开始，做到进化树。求大神帮助，步骤越详细越好啊！对这方面一窍不通

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1楼 2013-09-25 18:50:25

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yangdayuan

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
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kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-09-26 15:20:15

把你的序列放到NCBI或者韩国的一个网站上对比，会有很多跟你的鉴定出来的相似的菌株序列出来，把这些考到进化树分析软件（MEGA）上，按照软件的使用程序来做，进化树就出来了。我还是好几年前做菌株鉴定的时候做过，现在只记得大概程序，

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顺其自然，为所当为

2楼2013-09-26 15:04:27

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coldplay5

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引用回帖:

2楼: Originally posted by yangdayuan at 2013-09-26 15:04:27
把你的序列放到NCBI或者韩国的一个网站上对比，会有很多跟你的鉴定出来的相似的菌株序列出来，把这些考到进化树分析软件（MEGA）上，按照软件的使用程序来做，进化树就出来了。我还是好几年前做菌株鉴定的时候做过， ...

做出来很不好看，同源性太高？

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3楼2013-09-26 18:20:20

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