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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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coldplay5

新虫 (初入文坛)

[求助] 筛到一个菌,如何做进化树?

鉴定出来的是26s rDNA,是一株酵母菌,如何做进化树啊?现在只有序列,如何从这一步开始,做到进化树。求大神帮助,步骤越详细越好啊!对这方面一窍不通
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yangdayuan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-09-26 15:20:15
把你的序列放到NCBI或者韩国的一个网站上对比,会有很多跟你的鉴定出来的相似的菌株序列出来,把这些考到进化树分析软件(MEGA)上,按照软件的使用程序来做,进化树就出来了。我还是好几年前做菌株鉴定的时候做过,现在只记得大概程序,
顺其自然,为所当为
2楼2013-09-26 15:04:27
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coldplay5

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yangdayuan at 2013-09-26 15:04:27
把你的序列放到NCBI或者韩国的一个网站上对比,会有很多跟你的鉴定出来的相似的菌株序列出来,把这些考到进化树分析软件(MEGA)上,按照软件的使用程序来做,进化树就出来了。我还是好几年前做菌株鉴定的时候做过, ...

做出来很不好看,同源性太高?
3楼2013-09-26 18:20:20
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yangdayuan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-09-27 15:10:30
引用回帖:
3楼: Originally posted by coldplay5 at 2013-09-26 18:20:20
做出来很不好看,同源性太高?...

跟它在一只的有好几个吗,软件的参数设计都正常的吗,还有就是你在将菌株序列放到mega软件的比对的时候,有没有把前面的没有的剪切对齐的啊,应该可以应该可以做到跟一个菌在一个小分支上的
顺其自然,为所当为
4楼2013-09-27 14:23:39
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