| 查看: 6343 | 回复: 10 | |||||
xujc1983木虫 (著名写手)
苦逼青椒一枚
|
[交流]
VMD导出pdb文件，再导入MS 已有9人参与
|
|
VMD小白一枚，需要导出pdb文件，然后再导入MS。不得不说，还是习惯MS的界面。 发现问题是，所有的原子都没有原子质量。 原因在于，VMD导出的pdb格式将Occupancy都设为了0.00（倒数第二列）。不影响导入MS，导入后将所有原子的Occupancy再设为1就可以了。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子动力学 | 分子动力学-初级问题资源 |
» 猜你喜欢
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有3人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- VMD怎么读取data文件？
已经有14人回复
- VMD显示出问题如何解决
已经有7人回复
- 求助，如何构建聚合物分子PDB文件？
已经有4人回复
- 怎么将pdb文件导入ms啊
已经有6人回复
- cif文件没办法导入MS中？
已经有18人回复
- 把分子pdb文件修改后无法使用
已经有17人回复
- LAMMPS的轨迹文件怎么转换为VMD的PDB文件
已经有7人回复
- MS修改键长，MS画石墨烯，MS文件导入LAMMPS
已经有3人回复
- namd能量最小化完成后给我的十几个文件怎么没有pdb格式的呀
已经有6人回复
- 请教一下，怎样在复合物pdb里提取研究对象的pdb结构？
已经有15人回复
- 如何将pdb文件批量转换为mol2格式文件？
已经有10人回复
- MS建模问题求助
已经有13人回复
- vmd做pdb格式文件的动画求助
已经有12人回复
- VMD中如何将两个pdb文件合成一个新的pdb文件?
已经有14人回复
- 请问下图的介观结构是如何构建出来的？
已经有4人回复
- 【求助】namd和vmd就只能识别.pdb.psf.coor.vel等文件吗
已经有6人回复
Voland
金虫 (小有名气)
- 应助: 32 (小学生)
- 金币: 1102.6
- 红花: 9
- 帖子: 167
- 在线: 74.2小时
- 虫号: 2124041
- 注册: 2012-11-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2013-09-12 20:40:04
3楼2013-11-20 16:40:17
 |
4楼2013-11-20 21:49:13
xujc1983
木虫 (著名写手)
苦逼青椒一枚
- 应助: 71 (初中生)
- 金币: 2065.3
- 散金: 2373
- 红花: 18
- 帖子: 1096
- 在线: 575.3小时
- 虫号: 285496
- 注册: 2006-10-14
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
5楼2013-11-22 09:19:59
leegayway123
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 812.5
- 帖子: 85
- 在线: 21.4小时
- 虫号: 2799588
- 注册: 2013-11-14
- 性别: GG
- 专业: 膜生物化学与膜生物物理学
6楼2015-05-20 14:35:18
7楼2019-11-12 14:06:34
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
本帖内容被屏蔽 |
8楼2020-01-02 11:18:21
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
本帖内容被屏蔽 |
9楼2020-01-03 14:27:20
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
本帖内容被屏蔽 |
10楼2020-01-04 16:31:26
