| 查看: 5529 | 回复: 10 | |||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||
xujc1983木虫 (著名写手)
苦逼青椒一枚
|
[交流]
VMD导出pdb文件，再导入MS已有9人参与
|
||||
|
VMD小白一枚，需要导出pdb文件，然后再导入MS。不得不说，还是习惯MS的界面。 发现问题是，所有的原子都没有原子质量。 原因在于，VMD导出的pdb格式将Occupancy都设为了0.00（倒数第二列）。不影响导入MS，导入后将所有原子的Occupancy再设为1就可以了。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子动力学 | 分子动力学-初级问题资源 |
» 猜你喜欢
博士读完未来一定会好吗
已经有21人回复
-
导师想让我从独立一作变成了共一第一
已经有5人回复
-
到新单位后，换了新的研究方向，没有团队，持续积累2区以上论文，能申请到面上吗
已经有11人回复
-
读博
已经有4人回复
-
JMPT 期刊投稿流程
已经有4人回复
-
心脉受损
已经有5人回复
-
Springer期刊投稿求助
已经有4人回复
-
小论文投稿
已经有3人回复
-
Bioresource Technology期刊，第一次返修的时候被退回好几次了
已经有9人回复
-
申请2026年博士
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
VMD怎么读取data文件？
已经有14人回复- VMD显示出问题如何解决
已经有7人回复
- 求助，如何构建聚合物分子PDB文件？
已经有4人回复
- 怎么将pdb文件导入ms啊
已经有6人回复
- cif文件没办法导入MS中？
已经有18人回复
- 把分子pdb文件修改后无法使用
已经有17人回复
- LAMMPS的轨迹文件怎么转换为VMD的PDB文件
已经有7人回复
- MS修改键长，MS画石墨烯，MS文件导入LAMMPS
已经有3人回复
- namd能量最小化完成后给我的十几个文件怎么没有pdb格式的呀
已经有6人回复
- 请教一下，怎样在复合物pdb里提取研究对象的pdb结构？
已经有15人回复
- 如何将pdb文件批量转换为mol2格式文件？
已经有10人回复
- MS建模问题求助
已经有13人回复
- vmd做pdb格式文件的动画求助
已经有12人回复
- VMD中如何将两个pdb文件合成一个新的pdb文件?
已经有14人回复
- 请问下图的介观结构是如何构建出来的？
已经有4人回复
- 【求助】namd和vmd就只能识别.pdb.psf.coor.vel等文件吗
已经有6人回复
Voland
金虫 (小有名气)
- 应助: 32 (小学生)
- 金币: 1102.6
- 红花: 9
- 帖子: 167
- 在线: 74.2小时
- 虫号: 2124041
- 注册: 2012-11-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2013-09-12 20:40:04