应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 分子模拟超分子聚集，求指教！
51/1返回列表
查看: 1590  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

cao.qin

木虫 (正式写手)

[求助] 分子模拟超分子聚集，求指教！

本人是高分子材料专业，最近做的一个体系是利用32个氨基酸的多肽与两亲性二肽进行组装形成粒径约200nm的超分子聚集体，其主要相互作用为亲疏水相互作用以及正负电荷相互作用。我想问问各位大侠，我这个体系能否利用分子模拟来更直观的了解他们是如何聚集的，有没有比较适合的分子模拟软件！在此先感谢各位，希望大家多多指点。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
能为别人设想的人，永远不寂寞
1楼 2013-09-12 09:18:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kingchensi

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cao.qin at 2013-09-12 20:11:40
我就是不太懂这个，按我们老板的意思是好像很简单，他说一个星期就能搞定。那如果我们不模拟整个聚集体体系，只是模拟多肽与蛋白质的相互作用呢？...

2楼说的对，2楼是专家，这个体系确实不小啊，虽然我只懂个毛皮，可是32个氨基酸已经很大了
赞一下 回复此楼
热烈欢迎同行一起探讨！
5楼2013-09-25 10:55:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
cao.qin: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2013-09-12 20:09:31
gromacs 和NAMD 都可以模拟氨基酸，蛋白质等生物大分子，

问题是“200nm的超分子聚集体”这样的模拟体系会很大很大吧？得多强的计算资源才能算下来吧。
你先估算一下，你的模拟体系有多少个原子，看看你有多少计算资源吧
赞一下 回复此楼
2楼2013-09-12 11:27:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cao.qin

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-09-12 11:27:10
gromacs 和NAMD 都可以模拟氨基酸，蛋白质等生物大分子，

问题是“200nm的超分子聚集体”这样的模拟体系会很大很大吧？得多强的计算资源才能算下来吧。
你先估算一下，你的模拟体系有多少个原子，看看你有多少计 ...

我就是不太懂这个，按我们老板的意思是好像很简单，他说一个星期就能搞定。那如果我们不模拟整个聚集体体系，只是模拟多肽与蛋白质的相互作用呢？
赞一下 回复此楼
能为别人设想的人，永远不寂寞
3楼2013-09-12 20:11:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baobeizongzz
祝福祝福
4楼2013-09-12 20:38:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 17:39 by CgyNCDVNhGVg
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 17:23 by CgyNCDVNhGVg
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 17:15 by CgyNCDVNhGVg
[博后之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-15 16:50 by CgyNCDVNhGVg
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-15 16:15 by CgyNCDVNhGVg
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 3/150 2026-09-15 15:50 by CgyNCDVNhGVg
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-15 15:35 by CgyNCDVNhGVg
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-15 14:58 by CgyNCDVNhGVg
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 7/350 2026-09-15 14:49 by VMDqgnlKimtZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-15 14:34 by VMDqgnlKimtZ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-15 14:14 by VMDqgnlKimtZ
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 9/450 2026-09-15 14:10 by VMDqgnlKimtZ
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-15 14:02 by VMDqgnlKimtZ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 23jxep3nCNZb 2026-09-14 3/150 2026-09-15 09:38 by VMDqgnlKimtZ
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-15 07:02 by 5BDX0d0WFp7t
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-15 06:49 by 5BDX0d0WFp7t
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-15 06:14 by 5BDX0d0WFp7t
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:50 by 5BDX0d0WFp7t
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-15 05:22 by 5BDX0d0WFp7t
[考博] 27秋季材料博士申请求助 10+3 Cahal1 2026-09-11 4/200 2026-09-14 08:50 by 北京莱茵编辑
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭