| 查看: 3844 | 回复: 11 | |||
q1036210267木虫 (正式写手)
|
[求助]
分子动力学模拟 求 水分子的红外光谱
|
||
|
如题，最近几天，我通过查阅文献得知，分子动力学求某一物质的红外光谱 一般有两种方法，一是通过偶极矩的自相关函数求得，二是通过计算体系分子的速度自相关函数求得。于是我测试了一个简单分子（水分子）。我选择了含有500个水分子的一个模拟体系，先NPT系综算平衡，后NVT系综，这里我选择 步长0.5 fs，算了20000步（相关文献也是这么算的）。然后我用速度自相关函数求算其红外光谱，我得到的 归一化的自相关函数曲线（包括出峰位置和峰强度） 和文献报道的 一致，但是，从自相关函数到 红外光谱 还有一个傅里叶转换，我转换的时候总是得到错误的 红外光谱曲线，求木虫高人指点下这个傅里叶转换。在此 先谢谢您了，金币不够的话，我可以再追加。 [ 来自小组 珊瑚岛 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 晶体模型计算分析 |
» 猜你喜欢
人气不行了
已经有9人回复
-
没有任何消息-是不是就凉了
已经有6人回复
-
如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》
已经有5人回复
-
2026国自然函评费到账
已经有19人回复
-
能否退出参与的面上项目解除限项
已经有21人回复
-
建议基金发布提前给出明确的时间点
已经有16人回复
-
今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果
已经有21人回复
-
估计是周四
已经有4人回复
-
我面上完蛋了
已经有9人回复
-
范进中举一文的中心思想
已经有7人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- MS右键display style中的问题
已经有11人回复
- 水分子的分子动力学模拟中水分子跑出盒子
已经有10人回复
- VASP怎样计算水分子键长 键角
已经有9人回复
- 水动力及河流泥沙数值模拟（经典参考教材）
已经有121人回复
- MS模拟中能不能进行一些简单的化学变化？
已经有7人回复
- MS模拟体系中水分子数目应该怎样设置？
已经有9人回复
- Materials studio模拟聚合物红外光谱图
已经有32人回复
- 如何判断加多少个水分子？？？
已经有3人回复
- 【求助】MS如何实现水分子与SiO2反应的分子动力学模拟过程（想得到Si-OH键）？
已经有21人回复
- 【求助】关于磁流体的模拟
已经有4人回复
- 【求助】分子动力学模拟源代码
已经有11人回复
- 【求助】请教分子动力学模拟软件选择
已经有11人回复
- 【求助】求配位水分子在红外光谱中的振动范围
已经有19人回复
- 【求助】请教分子动力学模拟
已经有8人回复
- 【求助】如何求水分子半径
已经有3人回复
- 【求助】MS中动力学之后水分子个数问题
已经有5人回复
- 【请教】怎么计算键长平均值？
已经有6人回复
jerkwin
专家顾问 (正式写手)
-
专家经验: +14 - 应助: 454 (硕士)
- 金币: 20659.1
- 散金: 148
- 红花: 81
- 帖子: 813
- 在线: 2648.7小时
- 虫号: 1023452
- 注册: 2010-05-19
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
2楼2013-09-01 13:29:13
q1036210267
木虫 (正式写手)
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 2182.2
- 散金: 806
- 红花: 4
- 帖子: 893
- 在线: 262.1小时
- 虫号: 1346635
- 注册: 2011-07-15
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
3楼2013-09-01 14:05:52
jerkwin
专家顾问 (正式写手)
-
专家经验: +14 - 应助: 454 (硕士)
- 金币: 20659.1
- 散金: 148
- 红花: 81
- 帖子: 813
- 在线: 2648.7小时
- 虫号: 1023452
- 注册: 2010-05-19
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
4楼2013-09-01 21:32:25
q1036210267
木虫 (正式写手)
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 2182.2
- 散金: 806
- 红花: 4
- 帖子: 893
- 在线: 262.1小时
- 虫号: 1346635
- 注册: 2011-07-15
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
5楼2013-09-03 08:51:54
6楼2013-10-17 10:34:11
lvubaby
木虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 2417.5
- 散金: 20
- 红花: 2
- 帖子: 557
- 在线: 179小时
- 虫号: 1172683
- 注册: 2010-12-18
- 性别: MM
- 专业: 传热传质学
7楼2014-01-09 23:32:56
8楼2014-08-21 08:25:51
9楼2016-11-21 08:29:15
jerkwin
专家顾问 (正式写手)
-
专家经验: +14 - 应助: 454 (硕士)
- 金币: 20659.1
- 散金: 148
- 红花: 81
- 帖子: 813
- 在线: 2648.7小时
- 虫号: 1023452
- 注册: 2010-05-19
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
10楼2016-11-21 11:59:41
