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q1036210267管理员
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分子动力学模拟 求 水分子的红外光谱
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如题，最近几天，我通过查阅文献得知，分子动力学求某一物质的红外光谱 一般有两种方法，一是通过偶极矩的自相关函数求得，二是通过计算体系分子的速度自相关函数求得。于是我测试了一个简单分子（水分子）。我选择了含有500个水分子的一个模拟体系，先NPT系综算平衡，后NVT系综，这里我选择 步长0.5 fs，算了20000步（相关文献也是这么算的）。然后我用速度自相关函数求算其红外光谱，我得到的 归一化的自相关函数曲线（包括出峰位置和峰强度） 和文献报道的 一致，但是，从自相关函数到 红外光谱 还有一个傅里叶转换，我转换的时候总是得到错误的 红外光谱曲线，求木虫高人指点下这个傅里叶转换。在此 先谢谢您了，金币不够的话，我可以再追加。 [ 来自小组 珊瑚岛 ] |
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