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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 什么软件能够根据DNA序列给出相应的DNA双螺旋结构图？
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chhli3

铁虫 (初入文坛)

[求助] 什么软件能够根据DNA序列给出相应的DNA双螺旋结构图？

什么软件能够根据DNA序列给出相应的DNA双螺旋结构图？
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1楼 2013-08-29 19:50:33
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bugakbug

木虫 (正式写手)
Accelrys Discovery Studio 2.5
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3428892
??????
?????L?u??????DNA?p??????
?H??????!!

????r????@?????????DNA?Y??
????? NDB ??Y?????
(NDB:http://ndbserver.rutgers.edu/)
???????????@@
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2楼2013-08-30 01:01:44
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chhli3

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by bugakbug at 2013-08-30 01:01:44
Accelrys Discovery Studio 2.5
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3428892
板上有
但是繪製出?淼腄NA雙股螺旋
僅供參考!!

很多時候把這樣畫出?淼腄NA結構
拿去跟 NDB 的結構一比
(NDB:http://ndb ...

我有很多序列，不一定是NDB中有结构的序列，每一条序列都要生成DNA双螺旋结构的三维图，但是具体结构可以不正确，请问这个软件能满足我的要求吗？
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3楼2013-08-30 09:13:37
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bugakbug

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by chhli3 at 2013-08-30 09:13:37
我有很多序列，不一定是NDB中有结构的序列，每一条序列都要生成DNA双螺旋结构的三维图，但是具体结构可以不正确，请问这个软件能满足我的要求吗？...

可以，但是做出来的DNA结构只能是典型的
A form / B form / Z form
其它结构无法满足喔!
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4楼2013-08-30 09:39:18
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chhli3

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by bugakbug at 2013-08-30 09:39:18
可以，但是做出来的DNA结构只能是典型的
A form / B form / Z form
其它结构无法满足喔!...

还有个问题是软件做出来的三维图上，是否标有ATCG，以及是否可以灵活转动操作等？
因为软件比较大，想问明白了再下载，谢谢哈！
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5楼2013-08-30 10:26:49
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bugakbug

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
chhli3: 金币+5, ★★★很有帮助, 回复很有帮助，非常感谢。 2013-08-30 10:40:15
引用回帖:
5楼: Originally posted by chhli3 at 2013-08-30 10:26:49
还有个问题是软件做出来的三维图上，是否标有ATCG，以及是否可以灵活转动操作等？
因为软件比较大，想问明白了再下载，谢谢哈！...

做出?淼腜DB，
可以在 pymol / DS上做三維移動
標示ATCG也是基本指令(pymol)可以搞定
label參考: http://www.pymolwiki.org/index.php/Label
而DS具體操作可以參考一些教程
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6楼2013-08-30 10:32:53
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