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cpmd输入文件中原子坐标如何准备?
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cenwanglai
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cpmd输入文件中原子坐标如何准备?
CELL部分给出格子
ATOM给出给出原子坐标。与输出文件对照,似乎给出的是Bohr单位,而不是比例坐标或者三维直角坐标。
有人提出用MS和VESTA配合输出vasp格式的POSCAR,然后复制进cpmd就可以。但是vesta软件导出的POSCAR.vasp是比例坐标或者三维直角坐标。而不是原子单位坐标。
做cpmd的朋友是怎么做的呢?
cpmd坐标.png
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1楼
2013-08-22 16:00:49
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ChemiAndy
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专业: 理论和计算化学
在SYSYRM部分里加 ANGSTROM关键词,则CELL和坐标均为以A为单位。否则默认为原子单位。
ANGSTROM
Section: &SYSTEM
The atomic coordinates and the supercell parameters and several other parameters are read in Ångstroms.
Default is atomic units which are always used internally. Not supported for QMMM calculations.
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3楼
2013-08-23 10:56:24
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baoyuan6969
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性别: GG
专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
【答案】应助回帖
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cenwanglai: 金币+10,
★★★★★
最佳答案, 非常感谢~
2013-08-22 18:25:02
分数坐标不好使,会提示原子太近报错。用MS建好晶胞导成*.car文件,然后可以从car文件直接copy坐标到cpmd的输入文件。另外,我发现cpmd的输出文件中每步优化后给出的坐标是原子单位,而优化结束生成的xyz文件里的坐标可以直接用的。
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凡天下事敢做敢为者为之。
2楼
2013-08-22 17:11:29
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