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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » MS导出的cell文件中原子的坐标有点怪（希望作为VASP的POSCAR)
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

[交流] MS导出的cell文件中原子的坐标有点怪（希望作为VASP的POSCAR) 已有9人参与

CuAl2O4晶体
在MS导入晶体结构的cif文件，再导出的cell文件希望作为VASP的输入文件，但是原子的坐标有点怪，分数坐标大于1是怎么回事？希望指点一下？
另外不知导出cell文件方便，还是导出car文件比较好？导出car文件时需要用1*1*1的超晶胞吗？谢谢


MS的cell文件前面的部分
CODE:
%BLOCK LATTICE_CART
       0.000000000000000       4.006000041961669       4.006000041961670
       4.006000041961670      -0.000000000000001       4.006000041961671
       4.006000041961669       4.006000041961669       0.000000000000000
%ENDBLOCK LATTICE_CART

%BLOCK POSITIONS_FRAC
O:1   0.2606000006198883   0.2606000006198884   0.2606000006198884
O:1   0.2606000006198884   1.2606000006198885  -0.2818000018596651
O:1   1.2606000006198885  -0.2818000018596653   0.2606000006198885
O:1  -0.2818000018596651   0.2606000006198884   1.2606000006198883
O:1  -0.2606000006198884   0.7393999993801118   1.2818000018596651
O:1  -0.2606000006198884  -0.2606000006198883  -0.2606000006198884
O:1   0.7393999993801117   1.2818000018596651  -0.2606000006198884
O:1   1.2818000018596651  -0.2606000006198883   0.7393999993801116
Al:1   0.1250000000000000   0.1250000000000000   0.1250000000000001 MIXTURE:(   1  0.391000)
Al:1  -0.1250000000000001   0.8750000000000001   0.8750000000000001 MIXTURE:(   2  0.391000)
Al:2   0.4999999999999999   0.4999999999999999   0.5000000000000002 MIXTURE:(   3  0.804500)
Al:2   0.5000000000000000   1.5000000000000002  -1.0000000000000000 MIXTURE:(   4  0.804500)
Al:2   1.5000000000000002  -1.0000000000000002   0.5000000000000002 MIXTURE:(   5  0.804500)
Al:2  -1.0000000000000000   0.5000000000000000   1.5000000000000000 MIXTURE:(   6  0.804500)
Cu:1   0.1250000000000000   0.1250000000000000   0.1250000000000001 MIXTURE:(   1  0.609000)
Cu:1  -0.1250000000000001   0.8750000000000001   0.8750000000000001 MIXTURE:(   2  0.609000)
Cu:2   0.4999999999999999   0.4999999999999999   0.5000000000000002 MIXTURE:(   3  0.195500)
Cu:2   0.5000000000000000   1.5000000000000002  -1.0000000000000000 MIXTURE:(   4  0.195500)
Cu:2   1.5000000000000002  -1.0000000000000002   0.5000000000000002 MIXTURE:(   5  0.195500)
Cu:2  -1.0000000000000000   0.5000000000000000   1.5000000000000000 MIXTURE:(   6  0.195500)
%ENDBLOCK POSITIONS_FRAC

[ Last edited by xiaowu787 on 2011-7-13 at 10:56 ]
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1楼 2011-07-13 09:23:29
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

啸宇天涯

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
直接vesta导入cif, 导出.vasp，就是poscar了。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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8楼2013-07-13 15:25:30
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普通回帖

坏丫头飞飞

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
楼主，您好~我正在尝试合成CuAl2O4~请问CuAl2O4合成出来应该是什么颜色啊~
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2楼2011-10-17 19:30:19
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wenlinfeng

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
我学生做过，好像是偏白的。。。。
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热爱科研和教学,资料信息交流.
3楼2011-10-17 21:12:32
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
为了保持看起来是连续的一个体系，ms把晶胞中另一边的原子挪到一起，其实你减去1也是可以的。当然这样直接写入vasp的poscar也不会出错的
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
4楼2011-10-17 21:59:05
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★
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VASP支持这样的虚晶法建立模型么？看到后面几个原子位置都是MIXTURE的～
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思想重于技巧，内涵重于表象
5楼2011-10-18 14:30:38
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xiaowu787

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by souledge at 2011-10-18 14:30:38:
VASP支持这样的虚晶法建立模型么？看到后面几个原子位置都是MIXTURE的～

您好，能详细的说一下吗？刚接触这个，不太懂。谢谢
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6楼2011-10-19 16:13:51
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sungjen

银虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主，想知道怎么找到这个隐藏文件.cell的，我的文件夹目录下只有三个文件啊，请问怎么找到的
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希望有一天成为大神
7楼2013-07-13 14:45:32
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sxm2012

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by sungjen at 2013-07-13 14:45:32
楼主，想知道怎么找到这个隐藏文件.cell的，我的文件夹目录下只有三个文件啊，请问怎么找到的

在文件目录下，点击工具——文件下选项——查看——隐藏文件和文件夹——显示隐藏的文件
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9楼2013-09-03 12:51:32
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zhouyanan91

铁虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by sxm2012 at 2013-09-03 12:51:32
在文件目录下，点击工具——文件下选项——查看——隐藏文件和文件夹——显示隐藏的文件...

你好，文件目录在哪儿可以找到呢？  新手求教，不胜感激，一直找不到cell文件
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10楼2015-11-03 15:37:01
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