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yuy07

铁虫 (小有名气)

[交流] F-actin与β-actin 已有5人参与

一直没弄清楚F-actin与β-actin的区别,搜了很多资料,了解到actin不止一种,actin genes是一个大家族,植物里有60多个成员,而人类中也有30是多个成员。真核生物中主要是α-actin、β-actin、γ-actin。细胞中actin存在两种形式,一种是单体的G-actin,一种是多聚体F-actin。(这些都来自维基百科) 那么这里的γ-actin应该是gamma-actin的意思,G-actin(globular actin)是肌球蛋白,γ-actin与G-actin好像应该是不同的吧,但是在NCBI中搜到的结果却是相同,γ-actin与G-actin到底是不是同一个呢?
另外一个问题,nature cell biology上有篇文献报道进行血清饥饿的时候,观察F-actin,显示变少,说对细胞骨架有影响,但是下文在寻找下游调控时的western中却用actin(文章中没注明,应该是β-actin吧)做看家蛋白。我还查过其他文献很多也存在这个问题,然后我比对了gamma-actin与β-actin的氨基酸,发现它们两者只在N’端有4个氨基酸不一样,这样的话WB杂β-actin的时候不是把F-actin也算进去了吗?那就不合理了啊!
现在依旧晕晕乎乎,求大家释疑啊!

nature cell biology文献:
Mammalian TOR complex 2 controls the actin cytoskeleton and is rapamycin insensitive
http://www.nature.com/ncb/journal/v6/n11/full/ncb1183.html
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peakg7

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-08-27 22:30:46
alpha-actin, beta-actin and gamma-actin 都可以成为g-actin,只是存在的形式不一样
8楼2013-08-27 13:23:01
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15879003030

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-08-19 18:30:09
楼主这个问题提得很好,近些年是有些文献说了actin可能不适合做内参,理由有很多,但可能归可能,在没有找到更好的方法和基因之前,它仍然是目前western首选的内参基因。
2楼2013-08-19 13:13:16
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yuy07

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 15879003030 at 2013-08-19 13:13:16
楼主这个问题提得很好,近些年是有些文献说了actin可能不适合做内参,理由有很多,但可能归可能,在没有找到更好的方法和基因之前,它仍然是目前western首选的内参基因。

但是如果自己确定actin在自己的实验中是变的,肯定不能用啊,这就是我对那篇文献存在的疑问,不过这块具体的知识我了解的很有限,所以首先怀疑下是不是我自己哪里没弄明白。谢谢您回帖啦!
3楼2013-08-19 18:37:25
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biowandy

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
说的非常好!学习了

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2013-08-19 20:30:57
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