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我是小李飞刀

新虫 (小有名气)

[求助] 做verticillium dahliae(大丽轮枝菌)的RT-PCR,actin 基因引物的问题

各位虫虫大家好!最近提了verticillium dahliae的RNA,验证提取出来后将其反转录成cDNA,之后跑PCR却没有结果。用的引物是通过β -tubulin 2设计的引物 VertBt-F/VertBt-R.(文献一)。重复了一次仍没有结果,因此在想是不是引物的问题,因此想用 actin基因上设计的引物 ,但查找了好多文献都没找到,只看到文献二里提到 actin VActF and VActR (VDAG_08445.1).请问各位虫虫后边的编号指的什么,我该怎样查找该对引物的序列?或者大家谁有verticillium dahliae的actin基因的引物,请回复我哦!谢谢!
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  • 2013-01-21 22:20:31, 287.74 K
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-01-22 12:06:22
到NCBI上就可以查呀。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/170717011
VDAG-08445.1是locus tag
2楼2013-01-22 02:34:44
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我是小李飞刀

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-01-22 02:34:44
到NCBI上就可以查呀。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/170717011
VDAG-08445.1是locus tag

还是很晕啊,是根据ncbi上相应的序列自己设计引物吗?
3楼2013-01-22 09:51:35
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
我是小李飞刀: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-01-23 21:42:43
引用回帖:
3楼: Originally posted by 我是小李飞刀 at 2013-01-22 09:51:35
还是很晕啊,是根据ncbi上相应的序列自己设计引物吗?...

引物都是这样根据序列自己设计的。
4楼2013-01-22 11:41:34
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