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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 药物分析 » GC-MS 代谢组学数据预处理问题
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taiyang0209

银虫 (小有名气)

[交流] GC-MS 代谢组学数据预处理问题 已有7人参与

刚开始接触GC-MS，小白一个。现在在做代谢组学的分析。请问代谢组学数据预处理的步骤是什么，峰对齐需要什么软件，如何操作，本人不太明白这方面，希望帮忙解答的详细一些，谢谢

[ Last edited by taiyang0209 on 2013-7-18 at 12:35 ]
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1楼 2013-07-18 11:33:17
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airhblue11

银虫 (小有名气)
★
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一般来说，现在的仪器都配有相应的分析软件，如waters的Masslynx，热电的xcalibur等，这些软件好像都已经内置分析代谢组学的软件，你只需要对参数（如阈值）进行设定就可以直接进行代谢组学的数据分析，如PCA,PLS-DA等。代谢组学通用的软件也有，叫simca-p，Masslynx中的Markerlynx其实就是部分内置了这个软件。
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3楼2013-07-18 17:14:50
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taiyang0209

银虫 (小有名气)
求大家帮忙。。。
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2楼2013-07-18 13:28:52
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taiyang0209

银虫 (小有名气)
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4楼2013-07-19 09:52:01
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sean男孩

新虫 (初入文坛)
★
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数据预处理就是对原始数据进行提取，对齐，归一化分析，通过原始基峰离子(BPI)色谱图，初步观察仪器的保留时间重现性，所测得的物质数量，以及不同组之间的色谱图是否具有较明显的差异。
我们用的仪器是Leco，有自带的软件，你用的是Agilent的吗？可以考虑用METALIGH或者XCMS做。
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5楼2013-08-15 11:37:06
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wyxiaofan3

新虫 (小有名气)
★
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你好，你的问题解决了吗？我也是刚用气质做代谢组学分析，希望多多交流

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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6楼2013-10-18 11:55:49
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taiyang0209

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by wyxiaofan3 at 2013-10-18 12:55:49
你好，你的问题解决了吗？我也是刚用气质做代谢组学分析，希望多多交流

刚接触，啥也不懂呀。。你知道吗？
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7楼2013-10-23 15:15:28
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windy2016

金虫 (小有名气)
★
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亲，现在数据预处理做得怎样了？最近也准备做，请教下~
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8楼2014-09-02 17:58:06
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yaoyao8239

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问如何对数据进行归一化呀？
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9楼2014-11-28 14:51:13
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petty528

金虫 (正式写手)
我们用AMDIS
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真实的即是精彩的
10楼2014-12-01 16:06:13
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