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taiyang0209

银虫 (小有名气)

[交流] GC-MS 代谢组学数据预处理问题 已有7人参与

刚开始接触GC-MS,小白一个。现在在做代谢组学的分析。请问代谢组学数据预处理的步骤是什么,峰对齐需要什么软件,如何操作,本人不太明白这方面,希望帮忙解答的详细一些,谢谢

[ Last edited by taiyang0209 on 2013-7-18 at 12:35 ]
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airhblue11

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
一般来说,现在的仪器都配有相应的分析软件,如waters的Masslynx,热电的xcalibur等,这些软件好像都已经内置分析代谢组学的软件,你只需要对参数(如阈值)进行设定就可以直接进行代谢组学的数据分析,如PCA,PLS-DA等。代谢组学通用的软件也有,叫simca-p,Masslynx中的Markerlynx其实就是部分内置了这个软件。
3楼2013-07-18 17:14:50
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taiyang0209

银虫 (小有名气)

求大家帮忙。。。
2楼2013-07-18 13:28:52
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sean男孩

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
数据预处理就是对原始数据进行提取,对齐,归一化分析,通过原始基峰离子(BPI)色谱图,初步观察仪器的保留时间重现性,所测得的物质数量,以及不同组之间的色谱图是否具有较明显的差异。
我们用的仪器是Leco,有自带的软件,你用的是Agilent的吗?可以考虑用METALIGH或者XCMS做。
5楼2013-08-15 11:37:06
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wyxiaofan3

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你好,你的问题解决了吗?我也是刚用气质做代谢组学分析,希望多多交流

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
6楼2013-10-18 11:55:49
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