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王艳xinwei

银虫 (小有名气)

[求助] PBI121载体酶切后回收

各位虫友,最近小虾我在做表达载体的构建,要用到PBI121这个表达载体,进行双酶切后要对其胶回收,这两个酶切位点相距很近,中间就隔了BamH1,前段时间用OMEGA胶回收试剂盒做预实验没有回收到这么大片段的DNA,所以在这寻得帮助,怎样才能回收这么大片段的DNA,大小将近13kb。
       另一个问题是我用NEB家的酶,用Xba1和sma1进行双酶切,但是温度不统一,所以先进行了Sma1 25度单酶切,后没有电泳胶回收,而是直接将sma1 65度失活,再进行了xba1 37度酶切,同时加了BSA。这两个酶有通用的buffer,所以第二次的xba1酶切没再加buffer。NEB网站上介绍了这种分开酶切,不知道是因为上面介绍的原因,还是我自己理解问题,我就是没有弄明白中间是不是需要纯化再进行第二次的酶切,还是按我这用方式,希望得到大家的帮助
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坚持就是胜利
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wenzi6337

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 王艳xinwei at 2013-07-16 07:34:42
请问有没有NEB酶切3小时没有切开的现象,我昨天做了sma1酶切后,进行了xbaI酶切,竟然在打算回收的时候没有切下我的目的片段,我现在非常苦恼,怀疑自己构建的克隆载体都有问题了,但我测序结果没问题啊,请帮忙分 ...

我用的是Takara限制酶,NEB的不清楚,不过按照你说的情况,这两个酶切位点很近,是不是应该考虑保护碱基,有时保护碱基不足,酶活性只有20y要延长酶切时间甚至可以过夜酶切,如果不存在保护碱基问题可以尝试换别的公司限制酶试试。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
9楼2013-07-16 13:34:02
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查看全部 29 个回答

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
王艳xinwei: 金币+2, ★有帮助 2013-07-14 09:07:10
137167741: 金币+1, 小木虫交流,共同进步~~ 2013-07-16 09:14:14
对于大于10kb的片段,你可以试试大片段回收试剂盒。
酶作用温度不同完全可以按照你做的那样,用smaI切完后不用回收,失活后直接加xbaI做酶切。此外,如果只是把载体切成线状(两个酶切位点很近),你可以直接乙醇沉淀纯化回收片段,避免胶回收可能出现的问题。
2楼2013-07-14 00:26:03
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王艳xinwei

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-07-14 00:26:03
对于大于10kb的片段,你可以试试大片段回收试剂盒。
酶作用温度不同完全可以按照你做的那样,用smaI切完后不用回收,失活后直接加xbaI做酶切。此外,如果只是把载体切成线状(两个酶切位点很近),你可以直接乙醇沉 ...

谢谢,我还想问一下,后做xba1酶切的时候我就不用再一次加buffer了吧
坚持就是胜利
3楼2013-07-14 09:06:15
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
137167741: 金币+1, 小木虫交流,共同进步~~ 2013-07-16 09:14:23
引用回帖:
3楼: Originally posted by 王艳xinwei at 2013-07-14 09:06:15
谢谢,我还想问一下,后做xba1酶切的时候我就不用再一次加buffer了吧...

如果两个酶的buffer相同,不用再加buffer,还用原来的体系就可以了。
4楼2013-07-14 11:39:36
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