24小时热门版块排行榜    

查看: 1655  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

sars37

捐助贵宾 (小有名气)

[求助] 关于基因克隆的一些实验技术问题

小弟基因克隆新手,用的是限制性内切酶和连接,目前遇到两个问题,一个是用内切酶HindIII 和EcoRI 对有目的基因的质粒和PCDNA3.1酶切后,回收胶的回收率特别低,切完后看到的条带还很亮,回收后再电泳就很弱,测浓度发现只有10ng/ul左右,用的是QIAGEN的QIAEX II 试剂盒,小弟自己分析的原因是,50°水浴之后EP管里液体的颜色不够黄,也就是PH太高,没有调PH,还有一个就是在最后加水溶解DNA的时候水的PH偏酸,没有调到8.0。第二个问题是酶切的体系问题,含有目的基因的质粒酶切体系是10ul的Tvector,HindIII 和EcoRI各3ul,buffer4ul,共40ul体系,不知道PCDNA应该用什么样的体系,切多少,好像说连接的时候靶基因对质粒的摩尔数之比要在5-9:1,对这个概念我不是太懂。Tvector浓度是5.6ug/ul,纯化后的PCDNA浓度是0.86ug/ul。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
5楼: Originally posted by sars37 at 2013-07-13 15:49:21
好的,谢谢,关于T4连接酶的一些问题可能还要麻烦你。。比如反应体系什么的。。不知道DNA片段和载体DNA的pmol如何换算。...

我一般不考虑片段和载体的mol比等问题,但有一个原则就是尽量多的加你的片段和少加载体,体系一般用小体积连接,比如10ul,我3-15ul的体系都用过,你可以试试10ul体系

片段   若干,多加点
载体   400ng酶切回收20ul洗脱的话,加2ul足够了
10X T4 ligase buffer 1ul
Ligase   1ul
-----------------------------------
补水到10ul
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
6楼2013-07-13 15:58:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sars37: 金币+7, ★★★★★最佳答案 2013-07-13 15:49:40
1. 产物回收后,不用测浓度,到时候连接时,往体系里面多加点片段

2. 你的酶切体系有问题,EcoRI和HindIII酶根本不用这么多
质粒 1ug
EcoRI 1ul
HindIII 1ul
Buffer  2ul
-----------------------------
补齐水到20ul

目的基因的T载体,可以多切些,但1ug也足够了

载体一定要少切,一般400ng足够了,20ul体系,要充分保证载体被酶切开
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-07-13 15:27:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sars37

捐助贵宾 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2013-07-13 15:27:08
1. 产物回收后,不用测浓度,到时候连接时,往体系里面多加点片段

2. 你的酶切体系有问题,EcoRI和HindIII酶根本不用这么多
质粒 1ug
EcoRI 1ul
HindIII 1ul
Buffer  2ul
-----------------------------
补 ...

我的质粒浓度是5.6ug/ul,PCDNA的浓度是0.8ug/ul,也就是说把质粒稀释五倍后吸1ul酶切,PCDNA稀释两倍后吸1ul酶切吗?
3楼2013-07-13 15:34:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
3楼: Originally posted by sars37 at 2013-07-13 15:34:20
我的质粒浓度是5.6ug/ul,PCDNA的浓度是0.8ug/ul,也就是说把质粒稀释五倍后吸1ul酶切,PCDNA稀释两倍后吸1ul酶切吗?...

是这样子的,一定要控制好酶切的DNA量
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
4楼2013-07-13 15:35:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +6 困于星晨 2026-03-17 6/300 2026-03-18 10:21 by kkcoco25
[考研] 304求调剂 +11 小熊joy 2026-03-14 12/600 2026-03-18 09:59 by macy2011
[考研] 265求调剂 +3 梁梁校校 2026-03-17 3/150 2026-03-18 09:12 by zhukairuo
[考研] 301求调剂 +9 yy要上岸呀 2026-03-17 9/450 2026-03-18 08:58 by 无际的草原
[考研] 341求调剂 +5 捣蛋猪猪 2026-03-11 7/350 2026-03-17 19:09 by 捣蛋猪猪
[考研] 材料专硕326求调剂 +6 墨煜姒莘 2026-03-15 7/350 2026-03-17 17:10 by ruiyingmiao
[考研] 【0856】化学工程(085602)313 分,本科学科评估A类院校化学工程与工艺,诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 8/400 2026-03-17 16:57 by ruiyingmiao
[考研] 290求调剂 +6 孔志浩 2026-03-12 11/550 2026-03-17 14:41 by 周舟舟77
[考研] 机械专硕325,寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-14 3/150 2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油!? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 5/250 2026-03-14 16:30 by JourneyLucky
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂! +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
信息提示
请填处理意见