| 查看: 829 | 回复: 2 | ||
xingyanfei金虫 (正式写手)
|
[求助]
求自由能，用NAMD软件
|
|
体系有20275原子，除去水还有3340个原子，我想计算体系的自由能，用什么方法求呢？PMF, FEP，ABF?? 他们三个方法都适合什么样子的体系？ 比如说FEP，在教程中，都是小分子改变位置，在我的体系用，有很多原子改变了位置，可以用这种方法吗？ |
回复此楼» 猜你喜欢
262求调剂
已经有5人回复
-
0856调剂
已经有6人回复
-
张芳铭-中国农业大学-环境工程专硕-298
已经有6人回复
-
考研生物与医药调剂
已经有3人回复
-
274求调剂
已经有5人回复
-
化学工程085602 305分求调剂
已经有26人回复
-
334求调剂
已经有3人回复
-
一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕
已经有5人回复
-
看看我！301求调剂 081700
已经有3人回复
-
求调剂 生物学 377分
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 300金币求帮忙解决个PMF相关的问题
已经有10人回复
- 新手求助有关RMSD,RMSF等计算
已经有12人回复
- 蛋白质构象模拟
已经有12人回复
- 【求助】能计算化学反应的吉布斯自由能的软件
已经有4人回复
- 【求助】NAMD和Gromacs哪个简单？
已经有5人回复
- 【讨论】Gibbs自由能曲线上，两条曲线的公切线怎么求，相图软件可以自己标出来吗？
已经有5人回复
- 【求助】能够计算结合自由能的分子对接软件除了autodock还有哪些？
已经有7人回复
- 【求助】理论与计算化学新手求教
已经有13人回复
- 【讨论】计算模拟区期刊《RCS》分子模拟版征稿启事
已经有19人回复
fhh2626
木虫 (正式写手)
- 应助: 135 (高中生)
- 金币: 2354.1
- 红花: 7
- 帖子: 344
- 在线: 139小时
- 虫号: 1475956
- 注册: 2011-11-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2013-07-08 20:58:18
xingyanfei
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1897.7
- 红花: 2
- 帖子: 761
- 在线: 265.3小时
- 虫号: 1504011
- 注册: 2011-11-22
- 性别: MM
- 专业: 原子和分子物理
3楼2013-07-08 21:01:06
