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xingyanfei金虫 (正式写手)
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[求助]
求自由能，用NAMD软件
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体系有20275原子，除去水还有3340个原子，我想计算体系的自由能，用什么方法求呢？PMF, FEP，ABF?? 他们三个方法都适合什么样子的体系？ 比如说FEP，在教程中，都是小分子改变位置，在我的体系用，有很多原子改变了位置，可以用这种方法吗？ |
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