| 查看: 2868 | 回复: 5 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
真菌DNA提取测序的一些问题
|
||
|
最近想对一株筛选到的真菌测序鉴定下，以前也没做过分子方面的实验，想请教前辈们几个问题: 1.提取DNA时用的样品应该用什么，是用摇瓶里的菌丝体还是平板上的菌落（平板上的菌落上有孢子，会对提取有什么影响吗）？ 2.我看了下生工的试剂盒，一种是只有Buffer Digestion，Buffer PF，TE Buffer的DNA抽提试剂盒，还一种是Ezup柱式DNA抽提试剂盒（有纯化套件，Buffer Digestion，Buffer PF，Buffer BD，PW Solution，Wash Solution，TE Buffer，Proteinase K），应该买哪一种试剂盒？ 3.18S rDNA的通用引物NS1/NS8也是在生工合成吗？ 4.用做细菌的PCR反应体系有关系吗？ 5.PCR完后可以直接送去测序吗？我看了下论坛上的贴，ITS方法测序貌似和PCR产物直接测序没什么差别是吗？  望各位前辈赐教 |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有102人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 真菌被超级细菌污染咋办
已经有15人回复
- DNA测序是单向测序、和测通的区别。
已经有4人回复
- 大片段DNA测序的问题
已经有7人回复
- 我在跑胶时的DNA片段大小为什么与测序后的相差很大呢？？？求大侠指导！
已经有13人回复
- 求助——真菌DNA提取
已经有11人回复
- DNA提取测序，DNA提取后，电泳条带弥散拖尾
已经有7人回复
- 关于DNA测序末端终止法的一点问题？
已经有9人回复
- 测序后的DNA序列与预测的有几个碱基不同，怎么办
已经有18人回复
- 丝状真菌提取总DNA问题
已经有14人回复
- 土壤微生物总DNA提取试剂盒选购
已经有29人回复
- 为什么DNA提取总降解
已经有15人回复
- 【求助/交流】提取真菌DNA或RNA一定要液氮研磨吗？
已经有7人回复
- 【求助/交流】在真菌基因组中PCR基因，难吗？
已经有18人回复
- 【求助/交流】真菌的基因克隆与表达
已经有7人回复
5楼2014-05-29 13:25:08
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
王之御魂(myprayer代发): 金币+3, 回答很好，perfect 2013-07-08 17:37:33
王之御魂: 金币+50, ★★★很有帮助 2013-07-09 08:54:30
感谢参与，应助指数 +1
王之御魂(myprayer代发): 金币+3, 回答很好，perfect 2013-07-08 17:37:33
王之御魂: 金币+50, ★★★很有帮助 2013-07-09 08:54:30
|
1：一般将菌种接种到液体培养基上扩大培养得到的菌液去抽提基因组DNA; 2：试剂盒都么有什么太大的问题只要你能得到比较纯的基因组DNA; 3：18S引物都可以在生工合成； 4：PCR体系有细菌的也行的，同一扩增体系我都同时做16S/18S,都没问题； 5: PCR产物一般大于20ng/ul就可以送测序了 |
2楼2013-07-08 17:34:53
3楼2013-07-09 08:55:38
4楼2013-07-13 12:59:09
50