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小分子top获得方法
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我做gromas模拟，现在要得到诸如甲基丙烯酸，吡啶之类小分子的top文件，该如何得到？前段时间我是通过画出他们的分子式，得到pdb结构然后复制到frodrg网站在线获得top文件，不过这种方式得到的top文件中电荷组及电荷都不准，怎么解决这个问题啊？还有如果就用proidrg得到的top，不做修改直接用于模拟，这样可以吗？ 谢谢大家了 |
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