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jannver

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[求助] 请教DNA电泳问题,使用SYBR Green I 染色

请教DNA电泳问题,使用SYBR Green I 染色

我的操作简述如下:

1、2%低熔点琼脂糖100ml,加热后放凉到60度时,加入SYBR Green I 原液10ul,混匀后制胶。

2、将样品和loading buffer 按常规比例体积混合,10min后上样。

3、上样体积10ul,我的样品浓度约在200 nM。

4、电泳条件:70V(7V/cm),0.5 TBE Buffer,冰水浴电泳,3h。

5、我设了两个Ladder,一个范围是49kb~0.8kb,另一个范围是500bp~25bp。

这个实验重复了两层,结果类似,都好像有问题:

1、在电泳开始不久就发现样品条带有黄绿色带条出现,电泳结束是黄绿色带条变的很粗(信号强)。

2、目的条带和Ladder情况:

(1)M1 范围是49kb~0.8kb的Ladder 没有分离开,只出现3条带。
(2)M2范围是500bp~25bp的Ladder 有分开,但信号很弱(可能是我的上样浓度小了)。
(3)我的目的条带都应该在23kb附近,但是电泳结果信号都处于50bp,而且条带间横向没有分开,全连在一起了。
(4)我的目的条带理论上应该有梯带出现,但是没有出现。

说明:我的实验是用若干条序列彼此部分互补的50bp的单链DNA作为原料,通过缓慢淬火,使之形成DNA纳米结构,目标产物大小应该在23kb。

我的疑问是:

1、我的实验设计是不是有问题,根本没有形成纳米结构,所以电泳结果条带仍然是50bp,与原料很近。

2、是不是SYBR Green I 制胶的方法有误,不应该将SYBR Green I 直接加到胶里,而应该和样品预混后再上样才好。

3、是不是我的上样体积或样品浓度太大?

谢谢,希望得到高手指教。
请教DNA电泳问题,使用SYBR Green I 染色
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