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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp表面和吸附分子的结构分别优化后，如何将它们放到一起
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dingniu2

木虫 (正式写手)

[求助] vasp表面和吸附分子的结构分别优化后，如何将它们放到一起

如题，做表面吸附，请问分别优化了金属表面，和所选的吸附气体，如何将两者放到一起形成吸附初始构型？MS,VESTA,P4VASP哪个能做，如何做方便？
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健康最重要
1楼 2013-06-11 21:52:01
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天棚元帅

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
dingniu2: 金币+1, ★★★很有帮助 2013-06-12 09:29:16
同意三楼的，复杂点的用MS吧，简单的直接在POSCAR里修改就行~~
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A man gets what he earns when he earns it.
4楼2013-06-12 06:12:11
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天棚元帅

木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 零下1℃ at 2014-04-23 10:24:14
能不能请教一下，怎样在POSCAR文件里面做到简单修改，比如我想在金属表面吸附一个小原子，我已经知道了金属原子的坐标位置，然后怎样确定吸附原子的呢？谢谢...

一个原子的添加很简单，比如atop位，直接复制黏贴一个表面金属原子的xyz坐标，再稍微调大些z值就行了
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A man gets what he earns when he earns it.
9楼2014-04-24 04:53:50
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天棚元帅

木虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 零下1℃ at 2014-04-24 08:21:51
那我可不可以理解为：X.Y不变，Z方向上增大到介于成键与不成键之间的距离进行优化呢？谢谢...

可以，有经验的话，按照合理的键长值来设定，这样优化的会快些
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A man gets what he earns when he earns it.
11楼2014-04-25 22:59:03
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