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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp表面和吸附分子的结构分别优化后，如何将它们放到一起
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dingniu2

木虫 (正式写手)

[求助] vasp表面和吸附分子的结构分别优化后，如何将它们放到一起

如题，做表面吸附，请问分别优化了金属表面，和所选的吸附气体，如何将两者放到一起形成吸附初始构型？MS,VESTA,P4VASP哪个能做，如何做方便？
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1楼 2013-06-11 21:52:01
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零下1℃

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 天棚元帅 at 2013-06-12 06:12:11
同意三楼的，复杂点的用MS吧，简单的直接在POSCAR里修改就行~~

能不能请教一下，怎样在POSCAR文件里面做到简单修改，比如我想在金属表面吸附一个小原子，我已经知道了金属原子的坐标位置，然后怎样确定吸附原子的呢？谢谢
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8楼2014-04-23 10:24:14
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零下1℃

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 天棚元帅 at 2014-04-24 04:53:50
一个原子的添加很简单，比如atop位，直接复制黏贴一个表面金属原子的xyz坐标，再稍微调大些z值就行了...

那我可不可以理解为：X.Y不变，Z方向上增大到介于成键与不成键之间的距离进行优化呢？谢谢
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10楼2014-04-24 08:21:51
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零下1℃

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 天棚元帅 at 2014-04-25 22:59:03
可以，有经验的话，按照合理的键长值来设定，这样优化的会快些...

谢谢！
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12楼2014-04-26 09:29:04
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