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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 医学 » 基础 » 过表达基因序列---腺病毒包装用
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lijh1234

木虫 (小有名气)

[求助] 过表达基因序列---腺病毒包装用

我要做一个基因的过表达腺病毒包装，该基因表达的蛋白为（precursor），在细胞内会被切成N端和C端。但我只想要N端的序列，请问这个怎么查。
我在NCBI上查到了其蛋白的信息，但有些地方不大懂

FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..437
                     /organism="Mus musculus"
                     /strain="C57BL/6"
                     /db_xref="taxon:10090"
                     /chromosome="5"
                     /map="5 14.39 cM"
     Protein         1..437
                     /product="sonic hedgehog protein precursor"
                     /note="sonic hedgehog protein; HHG-1; hemimelic extra
                     toes; short digits"
     sig_peptide     1..24
                     /inference="non-experimental evidence, no additional
                     details recorded"
                     /note="Potential; propagated from UniProtKB/Swiss-Prot
                     (Q62226.2)"
                     /calculated_mol_wt=2530
     mat_peptide     25..437
                     /product="Sonic hedgehog protein"
                     /experiment="experimental evidence, no additional details
                     recorded"
                     /note="propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)"
                     /calculated_mol_wt=45261
     Region          26..185
                     /region_name="HH_signal"
                     /note="Hedgehog amino-terminal signalling domain;
                     pfam01085"
                     /db_xref="CDD:201590"
     Region          188..423
                     /region_name="Hint"
                     /note="Hint module; pfam01079"
                     /db_xref="CDD:144609"
     Site            198..199
                     /site_type="cleavage"
                     /inference="non-experimental evidence, no additional
                     details recorded"
                     /note="Cleavage, by autolysis (By similarity); propagated
                     from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)"
     Region          199..349
                     /region_name="Hint"
                     /note="Hedgehog/Intein domain, found in Hedgehog proteins
                     as well as proteins which contain inteins and undergo
                     protein splicing (e.g. DnaB, RIR1-2, GyrA and Pol). In
                     protein splicing an intervening polypeptide sequence - the
                     intein - is excised from a protein; cd00081"
                     /db_xref="CDD:73181"
     Site            order(199,271,348..349)
                     /site_type="other"
                     /note="protein-splicing catalytic site"
                     /db_xref="CDD:73181"
     Site            order(199,268,271)
                     /site_type="other"
                     /note="thioester formation/cholesterol transfer"
                     /db_xref="CDD:73181"
     Site            244
                     /site_type="other"
                     /inference="non-experimental evidence, no additional
                     details recorded"
                     /note="Involved in cholesterol transfer (By similarity);
                     propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)"
     Site            268
                     /site_type="other"
                     /inference="non-experimental evidence, no additional
                     details recorded"
                     /note="Involved in auto-cleavage (By similarity);
                     propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)"
     Site            271
                     /site_type="other"
                     /inference="non-experimental evidence, no additional
                     details recorded"
                     /note="Essential for auto-cleavage (By similarity);
                     propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)"
     CDS             1..437
                     /gene="Shh"
                     /gene_synonym="9530036O11Rik; Dsh; Hhg1; Hx; Hxl3;
                     M100081"
                     /coded_by="NM_009170.3:339..1652"
                     /db_xref="CCDS:CCDS19146.1"
                     /db_xref="GeneID:20423"
                     /db_xref="MGI:98297"
ORIGIN      
        1 mllllarcfl vilassllvc pglacgpgrg fgkrrhpkkl tplaykqfip nvaektlgas
       61 gryegkitrn serfkeltpn ynpdiifkde entgadrlmt qrckdklnal aisvmnqwpg
      121 vklrvtegwd edghhseesl hyegravdit tsdrdrskyg mlarlaveag fdwvyyeska
      181 hihcsvkaen svaaksggcf pgsatvhleq ggtklvkdlr pgdrvlaadd qgrllysdfl
      241 tfldrdegak kvfyvietle prerllltaa hllfvaphnd sgptpgpsal fasrvrpgqr
      301 vyvvaerggd rrllpaavhs vtlreeeaga yapltahgti linrvlascy avieehswah
      361 rafapfrlah allaalapar tdgggggsip aaqsatearg aeptagihwy sqllyhigtw
      421 lldsetmhpl gmavkss
//

我在想是不是我标红的那段，就是我想要的N-terminal部分？
是不是把这段直接给公司他们就可以做出来了？
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1楼 2013-05-03 19:46:46
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