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过表达基因序列---腺病毒包装用
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我要做一个基因的过表达腺病毒包装，该基因表达的蛋白为（precursor），在细胞内会被切成N端和C端。但我只想要N端的序列，请问这个怎么查。 我在NCBI上查到了其蛋白的信息，但有些地方不大懂 FEATURES Location/Qualifiers source 1..437 /organism="Mus musculus" /strain="C57BL/6" /db_xref="taxon:10090" /chromosome="5" /map="5 14.39 cM" Protein 1..437 /product="sonic hedgehog protein precursor" /note="sonic hedgehog protein; HHG-1; hemimelic extra toes; short digits" sig_peptide 1..24 /inference="non-experimental evidence, no additional details recorded" /note="Potential; propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)" /calculated_mol_wt=2530 mat_peptide 25..437 /product="Sonic hedgehog protein" /experiment="experimental evidence, no additional details recorded" /note="propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)" /calculated_mol_wt=45261 Region 26..185 /region_name="HH_signal" /note="Hedgehog amino-terminal signalling domain; pfam01085" /db_xref="CDD:201590" Region 188..423 /region_name="Hint" /note="Hint module; pfam01079" /db_xref="CDD:144609" Site 198..199 /site_type="cleavage" /inference="non-experimental evidence, no additional details recorded" /note="Cleavage, by autolysis (By similarity); propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)" Region 199..349 /region_name="Hint" /note="Hedgehog/Intein domain, found in Hedgehog proteins as well as proteins which contain inteins and undergo protein splicing (e.g. DnaB, RIR1-2, GyrA and Pol). In protein splicing an intervening polypeptide sequence - the intein - is excised from a protein; cd00081" /db_xref="CDD:73181" Site order(199,271,348..349) /site_type="other" /note="protein-splicing catalytic site" /db_xref="CDD:73181" Site order(199,268,271) /site_type="other" /note="thioester formation/cholesterol transfer" /db_xref="CDD:73181" Site 244 /site_type="other" /inference="non-experimental evidence, no additional details recorded" /note="Involved in cholesterol transfer (By similarity); propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)" Site 268 /site_type="other" /inference="non-experimental evidence, no additional details recorded" /note="Involved in auto-cleavage (By similarity); propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)" Site 271 /site_type="other" /inference="non-experimental evidence, no additional details recorded" /note="Essential for auto-cleavage (By similarity); propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)" CDS 1..437 /gene="Shh" /gene_synonym="9530036O11Rik; Dsh; Hhg1; Hx; Hxl3; M100081" /coded_by="NM_009170.3:339..1652" /db_xref="CCDS:CCDS19146.1" /db_xref="GeneID:20423" /db_xref="MGI:98297" ORIGIN 1 mllllarcfl vilassllvc pglacgpgrg fgkrrhpkkl tplaykqfip nvaektlgas 61 gryegkitrn serfkeltpn ynpdiifkde entgadrlmt qrckdklnal aisvmnqwpg 121 vklrvtegwd edghhseesl hyegravdit tsdrdrskyg mlarlaveag fdwvyyeska 181 hihcsvkaen svaaksggcf pgsatvhleq ggtklvkdlr pgdrvlaadd qgrllysdfl 241 tfldrdegak kvfyvietle prerllltaa hllfvaphnd sgptpgpsal fasrvrpgqr 301 vyvvaerggd rrllpaavhs vtlreeeaga yapltahgti linrvlascy avieehswah 361 rafapfrlah allaalapar tdgggggsip aaqsatearg aeptagihwy sqllyhigtw 421 lldsetmhpl gmavkss // 我在想是不是我标红的那段，就是我想要的N-terminal部分？ 是不是把这段直接给公司他们就可以做出来了？ |
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