| 查看: 1486 | 回复: 5 | |||
小木虫于金虫 (正式写手)
|
[求助]
siesta并行计算出错
|
|
我用ifort11+mvapich2并行编译siesta-3.2成功了，在arch.make中加入了DUMMY_FOX=--enable-dummy。并行计算时能运行很多步，但是总是在中途停止，出现错误： forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred Image PC Routine Line Source siesta 00000000008E320F Unknown Unknown Unknown libpthread.so.0 000000315820EB10 Unknown Unknown Unknown siesta 00000000008E31EB Unknown Unknown Unknown libpthread.so.0 000000315820EB10 Unknown Unknown Unknown ===================================================================================== = BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES = EXIT CODE: 44544 = CLEANING UP REMAINING PROCESSES = YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES ===================================================================================== 谁有解决办法。 |
回复此楼» 猜你喜欢
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有5人回复
-
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有74人回复
-
岩土工程学报什么时候才能终审完呐
已经有4人回复
-
时间戳又变了8-15
已经有25人回复
-
2027广东省杰青
已经有6人回复
-
快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。
已经有3人回复
-
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？
已经有9人回复
-
咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否
已经有26人回复
-
我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人
已经有16人回复
-
有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验）
已经有12人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助用siesta计算COHP
已经有16人回复
- vasp 集群并行出错
已经有7人回复
- 提交siesta任务计算失败
已经有11人回复
- ifort（mpiifort）并行编译siesta
已经有9人回复
- SIESTA计算能级不准怎么解决
已经有10人回复
- siesta计算dipole moment（电偶极矩）
已经有7人回复
- 原来编译的siesta突然不能用，重新编译没错，运行出错
已经有13人回复
- transiesta计算运行出错
已经有4人回复
- 关于SIESTA中如何计算功函数的一种做法探讨
已经有8人回复
- siesta计算弱相互作用VDW
已经有17人回复
- 【求助】siesta进行ordern计算出错求助
已经有4人回复
- 【求助】安装siesta2.0.2时如何编译arch.make？？
已经有17人回复
- 【求助】如何在siesta中设置ghost state原子的计算
已经有16人回复
- 【求助】哪位有siesta-3.0-rc2呀？
已经有8人回复
- 【求助】smeagol并行计算失败，求助
已经有5人回复
- 【求助】siesta 计算DOS应该注意什么问题
已经有3人回复
- 【求助】mkl+ifort+openmpi+siesta3.并行安装出错
已经有8人回复
- 【求助】siesta3.0 安装，错误一箩筐
已经有11人回复
- 【求助】siesta中transiesta模块的收敛问题
已经有13人回复
- 【求助】forrtl: error (78): 怎么回事？
已经有7人回复
2楼2013-04-05 13:27:42
小木虫于
金虫 (正式写手)
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 1055.4
- 散金: 160
- 红花: 1
- 帖子: 419
- 在线: 293.1小时
- 虫号: 1027530
- 注册: 2010-05-25
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
|
# # This file is part of the SIESTA package. # # Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid: # E.Artacho, J.Gale, A.Garcia, J.Junquera, P.Ordejon, D.Sanchez-Portal # and J.M.Soler, 1996- . # # Use of this software constitutes agreement with the full conditions # given in the SIESTA license, as signed by all legitimate users. # .SUFFIXES: .SUFFIXES: .f .F .o .a .f90 .F90 SIESTA_ARCH=x86_64-gnu--ifort11+mvapich2 FPP= FPP_OUTPUT= FC=/data3/home/yugd/mvapich2/bin/mpif90 RANLIB=ranlib SYS=nag SP_KIND=4 DP_KIND=8 KINDS=$(SP_KIND) $(DP_KIND) DUMMY_FOX=--enable-dummy FFLAGS=-O2 -mkl=parallel FPPFLAGS= -DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT LDFLAGS= ARFLAGS_EXTRA= FCFLAGS_fixed_f= FCFLAGS_free_f90= FPPFLAGS_fixed_F= FPPFLAGS_free_F90= MKL_PATH=$(MKLROOT)/lib/em64t BLAS_LIBS=/data3/home/yugd/intel/Compiler/11.1/072/mkl/interfaces/blas95/lib/em64t/libmkl_blas95_lp64.a LAPACK_LIBS=/data3/home/yugd/intel/Compiler/11.1/072/mkl/interfaces/lapack95/lib/em64t/libmkl_lapack95_lp64.a BLACS_LIBS=$(MKL_PATH)/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a SCALAPACK_LIBS= $(MKL_PATH)/libmkl_scalapack_lp64.a COMP_LIBS= NETCDF_LIBS= NETCDF_INTERFACE= LIBS=$(SCALAPACK_LIBS) $(BLACS_LIBS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) -L/data3/home/yugd/intel/Compiler/11.1/072/mkl/lib/em64t -lmkl_core -lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread -lguide -limf #SIESTA needs an F90 interface to MPI #This will give you SIESTA's own implementation #If your compiler vendor offers an alternative, you may change #to it here. MPI_INTERFACE=libmpi_f90.a MPI_INCLUDE=/data3/home/yugd/mvapich2/include #Dependency rules are created by autoconf according to whether #discrete preprocessing is necessary or not. .F.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_fixed_F) $< .F90.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_free_F90) $< .f.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_fixed_f) $< .f90.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_free_f90) $< 你好，这是我的arch.make，多谢帮我看一下问题在哪。能把你用ifort13+opimei1.6的arch.make发给我一份么，yugd0611@mails.jlu.edu.cn，多谢。 |
3楼2013-04-05 14:42:11
小木虫于4楼2013-04-05 14:46:59
小木虫于
金虫 (正式写手)
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 1055.4
- 散金: 160
- 红花: 1
- 帖子: 419
- 在线: 293.1小时
- 虫号: 1027530
- 注册: 2010-05-25
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
5楼2013-04-05 14:49:47
6楼2013-04-05 14:54:21
25