24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 949  |  回复: 5

guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】smeagol并行计算失败,求助 已有2人参与

这两天编译了smeagol1.0b,并行编译成功,但是能并行计算,如:
mpirun -np X ./smeagol <***
则提示段错误之类的。而当用
mpirun -np 1 ./smeagol <**
则能正常计算,不知道原因在哪,求助坛子里面的高手。先谢谢了!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ellsaking(金币+1):谢谢回帖交流~ 2010-12-15 16:28:36
引用回帖:
Originally posted by guohuazhong at 2010-12-15 02:42:59:
这两天编译了smeagol1.0b,并行编译成功,但是能并行计算,如:
mpirun -np X ./smeagol <***
则提示段错误之类的。而当用
mpirun -np 1 ./smeagol <**
则能正常计算,不知道原因在哪,求助坛子里面的 ...

试一试在你的bash里面写上ulimit -s unlimited
试试。
祝好运。
并且问一下你的编译器和mpi是什么版本?
弘德明志博学笃行
2楼2010-12-15 16:03:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-12-15 16:03:14:

试一试在你的bash里面写上ulimit -s unlimited
试试。
祝好运。
并且问一下你的编译器和mpi是什么版本?

我在bash里面写了,但还是没有作用,我用的编译器是ifort10.1和openmpi-1.4.1,同样的编译器在ubuntu10.10和centos 5.5上编译都是同样的不能并行。
3楼2010-12-15 16:27:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by guohuazhong at 2010-12-15 09:27:37:


我在bash里面写了,但还是没有作用,我用的编译器是ifort10.1和openmpi-1.4.1,同样的编译器在ubuntu10.10和centos 5.5上编译都是同样的不能并行。

你的arch.make能贴出来看看吗?
弘德明志博学笃行
4楼2010-12-15 19:06:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-12-15 19:06:04:

你的arch.make能贴出来看看吗?

SIESTA_ARCH=pg-mpif90
#
FC=mpif90  -convert big_endian -traceback -CB -heap-arrays -i_dynamic

FC_ASIS=$(FC)
#STACK   = -Wl,--heap,9000000,--stack,9000000  
FFLAGS= -w -mieee-fp -O0 -tpp7#-mtune=opteron -mieee-fp -zerouv -OPT:Ofast -O2
#LDFLAGS= -m64 -g -O0#-mtune=opteron -mieee-fp -zerouv -OPT:Ofast -O2
COMP_LIBS=
TRANSPORTFLAGS= -w -mieee-fp -O0 -tpp7 #-mtune=opteron -mieee-fp -zerouv -OPT:Ofast -O2 -c

SOURCE_DIR=/home/ghz/program/smeagol/smeagol.1.0b
EXEC = smeagol

#NETCDF_LIBS=/usr/local/netcdf-3.5/lib/pgi/libnetcdf.a
#NETCDF_INTERFACE=libnetcdf_f90.a
#DEFS_CDF=-DCDF

MPI_INTERFACE=libmpi_f90.a
MPI_INCLUDE=/opt/openmpi/include
DEFS_MPI=-DMPI



#BLACS=-L/opt/intel/mkl/10.1.2.024/lib/em64t -lmkl_blacs_openmpi_lp64
#/usr/support/acml2.5.0/gnu64/lib/libblacsCinit.a /usr/support/acml2.5.0/gnu64/lib/libblacsF77init.a /usr/support/acml2.5.0/gnu64/lib/libblacs.a
BLACS=/opt/intel/cmkl/10.1.2.024/lib/em64t/libmkl_blacs_lp64.a
GUIDE=/opt/intel/cmkl/10.1.2.024/lib/em64t/libguide.so
BLAS=-L/opt/intel/mkl/10.1.2.024/lib/em64t -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_lapack -lmkl_core #-lguide -pthread
LAPACK=/opt/intel/cmkl/10.1.2.024/lib/em64t/libmkl_def.so\
/opt/intel/cmkl/10.1.2.024/lib/em64t/libmkl_lapack.so \
/opt/intel/cmkl/10.1.2.024/lib/em64t/libmkl_scalapack.a
#LAPACK2=-L/opt/intel/mkl/10.1.2.024/lib/em64t -lmkl_scalapack_lp64
#/usr/support/acml2.5.0/gnu64/lib/libscalapack.a

#LAPACK=-L/opt/intel/mkl/10.1.2.024/lib/em64t -lmkl_sequential -lmkl_core  #-lguide -pthread#-pthread -lmkl_intel_thread

#BLAS=-L/opt/intel/mkl/10.1.2.024/lib/em64t -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_lapack -lmkl_core #-lguide -pthread

LIBS= -lpthread $(GUIDE) $(BLAS) $(LAPACK) $(BLACS)
RANLIB=echo
SYS=bsd
DEFS= $(DEFS_CDF) $(DEFS_MPI)
#
.F.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS)  $(DEFS) $<
.f.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS)   $<
.F90.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS)  $(DEFS) $<
.f90.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS)   $<
                            
#
5楼2010-12-15 21:56:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-12-16 07:53:40
引用回帖:
Originally posted by guohuazhong at 2010-12-15 14:56:12:



SIESTA_ARCH=pg-mpif90
#
FC=mpif90  -convert big_endian -traceback -CB -heap-arrays -i_dynamic

FC_ASIS=$(FC)
#STACK   = -Wl,--heap,9000000,--stack,9000000  
FFLAGS= -w -mieee-fp -O0 -tp ...

BLACS用上面的带openmpi的能解决问题。
弘德明志博学笃行
6楼2010-12-15 22:25:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 guohuazhong 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +8 xzghyuj 2026-04-04 8/400 2026-04-06 06:47 by houyaoxu
[考研] 315求调剂 +14 欣喜777 2026-04-04 15/750 2026-04-06 06:25 by houyaoxu
[考研] 327求调剂 +4 拾光任染 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:16 by 南航~万老师
[考研] 308求调剂 +4 maverick^_^ 2026-04-03 4/200 2026-04-05 19:08 by 蓝云思雨
[考研] 326求调剂 +3 顾若浮生 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:32 by 蓝云思雨
[考研] 0703化学321分求调剂 +17 三dd. 2026-03-30 18/900 2026-04-05 18:07 by 蓝云思雨
[考研] 专硕310求调剂 +5 捞捞我…. 2026-04-04 6/300 2026-04-04 23:33 by barlinike
[考研] 调剂 +11 JLLLLLLLLLL 2026-04-03 11/550 2026-04-04 22:21 by hemengdong
[论文投稿] 求文献 5+3 ys879651$ 2026-04-02 3/150 2026-04-04 17:22 by bobvan
[考研] 26调剂 086003 +6 失活的细胞 2026-04-04 6/300 2026-04-04 09:50 by zhangdingwa
[考研] 336求调剂 +8 kiyy 2026-04-01 8/400 2026-04-03 19:41 by lijunpoly
[考研] 材料与化工调剂一志愿大连海事085600,349 +11 吃的不少 2026-03-30 11/550 2026-04-03 18:05 by Jimmyandyou
[考研] 0703化学 +7 goldtt 2026-04-02 9/450 2026-04-03 09:36 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂!生物与医药专硕 +4 逆转陆先生 2026-04-01 5/250 2026-04-03 08:33 by Jaylen.
[考研] 一志愿武汉理工0856,初试334 +3 26考研材料 2026-04-02 3/150 2026-04-02 21:22 by dongzh2009
[论文投稿] chinese chemical letters英文版投稿求助 120+4 Yishengeryi 2026-03-30 6/300 2026-04-02 17:19 by Yishengeryi
[考研] 298求B区调剂 +4 zzz,,r 2026-04-02 5/250 2026-04-02 12:17 by 土木硕士招生
[考研] 322求调剂 +5 熹僖XX 2026-03-31 6/300 2026-04-02 10:08 by 求调剂zz
[考研] 求调剂0703 +5 周嘉尧 2026-03-31 8/400 2026-04-01 20:32 by ltltkkk
[考研] 358求调剂 +3 王向阳花 2026-03-31 3/150 2026-04-01 09:56 by zzchen2000
信息提示
请填处理意见