应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » DNAMAN拼接序列如何保存为线性序列？
51/1返回列表
查看: 4306  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhsp07

金虫 (小有名气)

[求助] DNAMAN拼接序列如何保存为线性序列？

华大测序的16S 未给拼接，只好自己拼接了，实验室里一直用DNAMAN拼接的，不过拼出来的序列导出后却没法直接拿去blast，是这样的，
GCCCAGGCGCTCATAAGGGGCATGATGAATGATGATTTGACGTCAT          300 TTTGTCACCGGCAGTCACCTTAGAGTGCCCAACTGAATGCTGGCAA          360
AAGATCAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGA      420
还得手动删除后面的数字，有没有哪位大侠知道如何让导出的序列是连续的？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
车到山前必有路!
1楼 2013-03-27 11:17:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhsp07

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by niil at 2013-03-27 12:09:05
带数字的序列是不影响blast的。直接拷到blast界面的序列窗口就可以了。数字会被忽略掉。
如果非要去掉数字的话，你输出的seq文件用DNAstar里的editseq 程序打开就可以了。我不太清楚DNAman里面是否有格式序列的功能 ...

谢谢。直接去比对确实可以，不过刚才试了一下，剪切两边的序列时，看着很不好看，而且比对比较多的时候，粘贴新的序列的时候也挺麻烦的。
赞一下 回复此楼
车到山前必有路!
3楼2013-03-27 13:52:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

niil

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhsp07(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-04-27 14:34:04
zhsp07: 金币+1 2013-08-27 08:18:39
带数字的序列是不影响blast的。直接拷到blast界面的序列窗口就可以了。数字会被忽略掉。
如果非要去掉数字的话，你输出的seq文件用DNAstar里的editseq 程序打开就可以了。我不太清楚DNAman里面是否有格式序列的功能能实现你的想法。
赞一下 回复此楼
Stop fighting,let it flow.
2楼2013-03-27 12:09:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

niil

金虫 (正式写手)
★
zhsp07(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖交流！ 2013-04-27 14:34:19
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhsp07 at 2013-03-27 13:52:34
谢谢。直接去比对确实可以，不过刚才试了一下，剪切两边的序列时，看着很不好看，而且比对比较多的时候，粘贴新的序列的时候也挺麻烦的。...

那我建议你换个软件，比如DNAstar、vectorNTI，都可以做拼接。
换个软件换个心情哦！
赞一下(1人) 回复此楼
Stop fighting,let it flow.
4楼2013-03-27 15:52:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhsp07

金虫 (小有名气)
看峰图是用另外一个软件，ChromasLite，DNAman只能拼接，不能看图谱吧？
赞一下 回复此楼
车到山前必有路!
6楼2013-07-07 09:29:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +37 医学老男孩 2026-08-13 86/4300 2026-08-18 00:18 by longsantaizi
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +4 基诺咪客 2026-08-17 4/200 2026-08-17 16:10 by Vivilian
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭