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yuezhonghui木虫 (著名写手)
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[求助]
【求助】一些A、B类错误求解
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各位大神，在下晶体有些A、B类错误，恳求实质性指导，特别是A类错误，多谢！ Alert level A PLAT341_ALERT_3_A Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.1022 Ang PLAT431_ALERT_2_A Short Inter HL..A Contact Cl2 .. O1 . 2.53 Ang. Alert level B PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O1 PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O2 |
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【答案】应助回帖
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yuezhonghui: 金币+5, ★★★很有帮助, 多谢！ 2013-03-10 21:57:46
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yuezhonghui: 金币+5, ★★★很有帮助, 多谢！ 2013-03-10 21:57:46
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PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O1 PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O2 水分子上头加氢一般不用理论加氢，可以通过q值残余峰加氢。首先请给足q的数量（比如plan 80），精修几轮，然后检查O1和O2上是否有键连的比较符合水分子键长和键角的q，如果有，就可以直接把这样的q命名为H再精修就可以。 Alert level A PLAT341_ALERT_3_A Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.1022 Ang PLAT431_ALERT_2_A Short Inter HL..A Contact Cl2 .. O1 . 2.53 Ang. 第一个关于C-C Bonds 精度的问题不知道怎样回答。关于第2个问题 Cl2 .. O1 距离建议使用DFIX命令。 可能是你使用DFIX命令写的不对，应该是：DFIX 3.53 Cl2 O1。另外建议首先DFIX的距离可以短一些，比如3.53 然后再测量一下Cl2 O1的距离，看DFIX命令是否起作用。如果起作用你就可以重新设置Cl2 O1距离进行精修。请注意你使用DFIX改变的距离越大，一般R值升高的也越大。 |
8楼2013-03-10 21:05:50
yuezhonghui
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yuezhonghui
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3楼2013-03-09 23:13:45
yuezhonghui
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