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471276585

金虫 (正式写手)

[求助] 有谁能帮忙解决几个A类B类错误,急急急!

有谁能帮忙解决几个A类B类错误,需要什么文件我再上传
Alert level A
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   0.274
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       0.27      
PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........          ?
PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .        295 A**3
PLAT052_ALERT_1_B Info on Absorption Correction Method Missing ...          ?
PLAT342_ALERT_3_B Low Bond Precision on  C-C Bonds ...............     0.0317 Ang  
PLAT415_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-X       H1     ..  H19A    ..       1.97 Ang.
PLAT415_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-X       H1     ..  H19A    ..       1.97 Ang.
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O1     -   H1     ...          ?      
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O1     -   H15    ...          ?
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linhua0402313

版主 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lijunjie84(金币+2): 谢谢回帖交流! 2012-01-03 17:02:52
471276585(金币+2): 2012-01-13 08:39:15
Alert level A
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   0.274
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       0.27  
上面的这几个错误是说明你的漂移值太大了,就是你的结构还没有完全解析好,晶体数据并没有收敛,所以你应该先把结构解析没有问题在进行check
身在高山独抚琴,心随流水会知音
2楼2012-01-03 10:05:13
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Giji521

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
木瓜少爷(金币+1): 鼓励回帖交流 2012-01-03 22:18:36
471276585(金币+1): 2012-01-13 08:39:34
PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........          ?
是你的空间群没有给出来,这个你在check的时候最上面会有空间群提示,找到填到CIF文件里就可以了
3楼2012-01-03 21:40:49
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chilajiao

金虫 (知名作家)

深海家族No.1

优秀版主

Additional refinement cycles may be required.

精修个二三十轮试试
只爱乐儿
4楼2012-01-04 11:35:01
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471276585

金虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by chilajiao at 2012-01-04 11:35:01:
Additional refinement cycles may be required.

精修个二三十轮试试

修了100轮也就这样,不知道哪里的问题!
5楼2012-01-05 09:06:41
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Tosser

木虫 (正式写手)


木瓜少爷(金币+1): 鼓励回帖交流 2012-01-06 13:11:33
看看是那个原子的漂移。然后解决。光增加精修次数没多大效果。
6楼2012-01-05 09:14:59
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471276585

金虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by Tosser at 2012-01-05 09:14:59:
看看是那个原子的漂移。然后解决。光增加精修次数没多大效果。

你好,麻烦问一下,怎么看是哪个原子的漂移啊?然后咋解决啊
7楼2012-01-05 16:09:58
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lib_1980

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
471276585(金币+2): 2012-01-13 08:40:26
在做xl的界面是能看到max shift在哪个原子上,然后再看是什么原因导致了该原子不收敛
8楼2012-01-05 22:21:27
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ifent

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
471276585(金币+1): 2012-01-13 08:40:42
...........直接修20轮就搞定了,如果还没搞定,看哪个原子在飘,固定就可以了
9楼2012-01-06 13:01:22
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

重点需要解决A类问题和1类问题。下面和你探讨:
Alert level A
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   0.274
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       0.27
你需要多轮精修,一般10轮左右精修,把Maximum Shift数值精修到趋近于0。

PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........          ?
你需要在最后的cif文件中填写上空间群符号,在ins和res文件的第一行就有。

PLAT052_ALERT_1_B Info on Absorption Correction Method Missing ...          ?
吸收校正的方法需要填写。如果你是使用multi-scan或者其他的方法, 如实填写就可以了。
老歪博
10楼2012-01-29 08:24:32
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