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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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xiaoyangyulv

金虫 (小有名气)

[交流] 【请教】在checkcif中出现a和b错误,应该如何修改?已有4人参与

稀土的配位化合物中
在checkcif时出现了a错误:
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .....        O4W     
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .....       O5W     
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......        O6W
这个是什么意思呢?这个用不用管他??

另外一个结构出现了b错误:

PLAT213_ALERT_2_B Atom C15             has ADP max/min Ratio .....       4.90 oblat

这个是什么意思呢?应该怎么修改呀

谢谢高手们!!!

[ Last edited by xiaoyangyulv on 2010-7-28 at 04:10 ]
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linhua0402313

版主 (文坛精英)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-07-28 16:48:54
对于A类错误是说水上没加氢,能加则加,不能说明一下即可,具体的操作就是找到合适的H位置后,在ins文件里把加上的H原子放在相应的O原子后面,前面加AFIX 3 固定,并且把氢原子的温度因子改为-1.5000,然后精修
身在高山独抚琴,心随流水会知音
2楼2010-07-28 07:53:44
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xiaoyangyulv

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by linhua0402313 at 2010-07-28 07:53:44:
对于A类错误是说水上没加氢,能加则加,不能说明一下即可,具体的操作就是找到合适的H位置后,在ins文件里把加上的H原子放在相应的O原子后面,前面加AFIX 3 固定,并且把氢原子的温度因子改为-1.5000,然后精修

谢谢你!!但不知道B类错误是什么意思啊?

[ Last edited by xiaoyangyulv on 2010-7-29 at 22:37 ]
3楼2010-07-29 22:36:09
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hanhaixf-77

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
A类错误:结构中存在孤立氧原子,建议查看是不是缺失了氢原子——不过,要根据自己的化合物确定,因为不一定是水的氧原子

B类错误:C15 需要重新做各向异性精修或者考虑无序的可能性(如果数据不够好,这个估计做不到!,所以错误级别为B)
4楼2010-08-11 16:16:49
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xiaoyangyulv

金虫 (小有名气)

非常感谢
5楼2010-08-11 17:39:13
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knight1014

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
水上没有加氢,并且C15非正定,这可能在你精修完全后会自动消失,实在不行也可以手动固定热参数。不过最好不要
6楼2010-08-11 17:39:16
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