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sjc1720

金虫 (正式写手)

[求助] 求助两个B类错误,先谢了!

PLAT201_ALERT_2_B Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) .......          1      
PLAT303_ALERT_2_B Full Occupancy H-Atom  H19B   with # Connections  3
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lijunjie84

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【答案】应助回帖

sjc1720(金币+1): 2011-04-18 17:44:44
看下这个帖子,集锦了大部分A类,B类错误!http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2768638
2楼2011-04-18 13:05:28
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sjc1720

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by lijunjie84 at 2011-04-18 13:05:28:
看下这个帖子,集锦了大部分A类,B类错误!http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2768638

我看过了,就是没有我这个问题的解决办法呀!
下面是关于这两个错误的具体解释:(本人一头雾水,请高人指点一下)
This test reports on non-hydrogen atoms that were refined with isotropic
displacement parameters only in the main residue. Such a practice is unusual
by modern standards and only needed for minor disorder modelling.

Hydrogen atoms are generally connected to only one other atom. A hydrogen atom between two oxygen atoms is a special case. Investigate whether this hydrogen atom is better described with a disorder model with two partially occupied sites. A difference map might show a double-well density.
3楼2011-04-18 14:27:43
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sjc1720

金虫 (正式写手)

在线等了一下午都没人解决。
4楼2011-04-18 17:45:26
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lijunjie84

版主 (职业作家)

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优秀版主

【答案】应助回帖

sjc1720(金币+2): 谢谢,但目前还是不知道怎么改。 2011-04-18 21:01:11
帝夫(CMEI+1): 2011-04-18 21:28:26
引用回帖:
Originally posted by sjc1720 at 2011-04-18 14:27:43:
我看过了,就是没有我这个问题的解决办法呀!
下面是关于这两个错误的具体解释:(本人一头雾水,请高人指点一下)
This test reports on non-hydrogen atoms that were refined with isotropic
displacem ...

第一个是各向同性参数有问题,可能是有些原子不需要进行各向异性精修。第二个是有H加错了,处理方法人家其实给出来了。
5楼2011-04-18 20:01:23
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sjc1720

金虫 (正式写手)

本人绝对是菜鸟,看透的大侠能否说的具体些。比如加个什么命令,或是怎么精修之类的。谢谢了!
6楼2011-04-18 21:03:41
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bswk

铜虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

sjc1720(金币+5): 谢谢,我先试试! 2011-04-20 15:40:20
PLAT201_ALERT_2_B Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) .......          1      这个问题在INS中加anis
PLAT303_ALERT_2_B Full Occupancy H-Atom  H19B   with # Connections  3
重加H19B
7楼2011-04-19 16:23:41
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sjc1720

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by bswk at 2011-04-19 16:23:41:
PLAT201_ALERT_2_B Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) .......          1      这个问题在INS中加anis
PLAT303_ALERT_2_B Full Occupancy H-Atom  H19B   with # Connections  3
重加H19B

第一个问题解决了,第二个还是不行。因为我给C19连着的无序原子c20做裂分后,那个H19B就和C20‘以及H20E连在一起了,所以就练了三个键,可是我在ins里重给C19 加H了,还是一样的问题,仍然连在一起,怎么办呢?急呀!请求高人指点,币币会追加的!
8楼2011-04-20 17:22:59
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sjc1720

金虫 (正式写手)

帖子快沉了,问题还没解决。
9楼2011-04-21 10:17:01
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