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mcp2010

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】怎样修改五个B类错误

Alert level B
DIFMX01_ALERT_2_B  The maximum difference density is > 0.1*ZMAX*1.00
            _refine_diff_density_max given =      0.982
            Test value =      0.700
RFACG01_ALERT_3_B  The value of the R factor is > 0.15
            R factor given   0.154
PLAT026_ALERT_3_B Ratio Observed / Unique Reflections too Low ....         34 Perc.
PLAT097_ALERT_2_B Large Reported Max.  (Positive) Residual Density       0.98 eA-3
PLAT340_ALERT_3_B Low Bond Precision on  C-C Bonds (x 1000) Ang ..         14      
每个到底怎样改啊?
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caty

至尊木虫 (著名写手)

小木虫潜水俱乐部名誉主席


nash603(金币+1):谢谢回贴交流! 2010-09-10 08:55:01
mcp2010(金币+15): 2010-09-10 20:02:39
DIFMX01_ALERT_2_B  The maximum difference density is > 0.1*ZMAX*1.00
            _refine_diff_density_max given =      0.982
            Test value =      0.700
可能的解决办法:吸收矫正;数据不好,重新收集数据;模型错误,包括归属错误、原子丢失、无序或溶剂处理有误;

RFACG01_ALERT_3_B  The value of the R factor is > 0.15
            R factor given   0.154
做一下吸收矫正试试。另考虑是否存在原子定错、溶剂分子没有指定等情况;

PLAT026_ALERT_3_B Ratio Observed / Unique Reflections too Low ....         34 Perc.
可观测点和独立衍射点比率过低;

PLAT097_ALERT_2_B Large Reported Max.  (Positive) Residual Density       0.98 eA-3
残余峰大,有可能是鬼影,也有可能是原子定错等模型错误。如果能有其他测试证明,说明一下通过审稿应该没问题;

PLAT340_ALERT_3_B Low Bond Precision on  C-C Bonds (x 1000) Ang ..         14      
C-C键精度不够,误差太大。找到出问题的C-C键,限制一下试试。

最好重新培养晶体,重新收集数据
谋事在人,成事在天
2楼2010-09-10 02:15:11
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


nash603(金币+1):谢谢回贴交流! 2010-09-10 08:55:15
mcp2010(金币+5): 2010-09-10 20:02:23
数据部佳, 点弱,
原子可能没加完, 也没精修好。
xi2004-emuch@163.com
3楼2010-09-10 08:41:18
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linhua0402313

版主 (文坛精英)


nash603(金币+1):谢谢回贴交流! 2010-09-10 08:55:23
mcp2010(金币+10): 2010-09-10 20:02:47
从你的错误看,你的晶体数据很差,这样的数据进行cif check是没有任何意义的,同样对出现的错误进行的修改也没有任何意义,建议重新解析结构,等所有数值都符合要求了再进行check
身在高山独抚琴,心随流水会知音
4楼2010-09-10 08:47:03
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