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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【求助】怎样修改五个B类错误
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mcp2010

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】怎样修改五个B类错误

Alert level B
DIFMX01_ALERT_2_B  The maximum difference density is > 0.1*ZMAX*1.00
            _refine_diff_density_max given =      0.982
            Test value =      0.700
RFACG01_ALERT_3_B  The value of the R factor is > 0.15
            R factor given   0.154
PLAT026_ALERT_3_B Ratio Observed / Unique Reflections too Low ....         34 Perc.
PLAT097_ALERT_2_B Large Reported Max.  (Positive) Residual Density       0.98 eA-3
PLAT340_ALERT_3_B Low Bond Precision on  C-C Bonds (x 1000) Ang ..         14      
每个到底怎样改啊？
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1楼 2010-09-10 00:37:40
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caty

至尊木虫 (著名写手)

小木虫潜水俱乐部名誉主席
★
nash603(金币+1):谢谢回贴交流！ 2010-09-10 08:55:01
mcp2010(金币+15): 2010-09-10 20:02:39
DIFMX01_ALERT_2_B  The maximum difference density is > 0.1*ZMAX*1.00
            _refine_diff_density_max given =      0.982
            Test value =      0.700
可能的解决办法：吸收矫正；数据不好，重新收集数据；模型错误，包括归属错误、原子丢失、无序或溶剂处理有误；

RFACG01_ALERT_3_B  The value of the R factor is > 0.15
            R factor given   0.154
做一下吸收矫正试试。另考虑是否存在原子定错、溶剂分子没有指定等情况；

PLAT026_ALERT_3_B Ratio Observed / Unique Reflections too Low ....         34 Perc.
可观测点和独立衍射点比率过低；

PLAT097_ALERT_2_B Large Reported Max.  (Positive) Residual Density       0.98 eA-3
残余峰大，有可能是鬼影，也有可能是原子定错等模型错误。如果能有其他测试证明，说明一下通过审稿应该没问题；

PLAT340_ALERT_3_B Low Bond Precision on  C-C Bonds (x 1000) Ang ..         14      
C-C键精度不够，误差太大。找到出问题的C-C键，限制一下试试。

最好重新培养晶体，重新收集数据
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谋事在人，成事在天
2楼2010-09-10 02:15:11
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
nash603(金币+1):谢谢回贴交流！ 2010-09-10 08:55:15
mcp2010(金币+5): 2010-09-10 20:02:23
数据部佳， 点弱，
原子可能没加完， 也没精修好。
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xi2004-emuch@163.com
3楼2010-09-10 08:41:18
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linhua0402313

版主 (文坛精英)
★
nash603(金币+1):谢谢回贴交流！ 2010-09-10 08:55:23
mcp2010(金币+10): 2010-09-10 20:02:47
从你的错误看，你的晶体数据很差，这样的数据进行cif check是没有任何意义的，同样对出现的错误进行的修改也没有任何意义，建议重新解析结构，等所有数值都符合要求了再进行check
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身在高山独抚琴，心随流水会知音
4楼2010-09-10 08:47:03
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