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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 如何查找一个蛋白DNA结合域的基因序列？
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xy656691

金虫 (正式写手)

[求助] 如何查找一个蛋白DNA结合域的基因序列？

我有一个蛋白，比如说ARF2（拟南芥），已知这个蛋白的DNA结合域位于氨基端，也知道这个这个蛋白的CDS序列，那么我如何知道编码这个结构域的基因序列（或者说是整个蛋白CDS序列中的哪一段编码的这个DNA结合域）呢？
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1楼 2013-01-31 17:13:40
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雷大利

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xy656691: 金币+4 2013-06-02 10:55:46
可以尝试用CHIP的方法检测
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哈哈
2楼2013-02-01 09:21:20
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jdzhang

铜虫 (小有名气)
如果对ARF已经有研究的话，可以通过蛋白结构域预测软件直接预测，当然可以通过EMSA、CHIP等方法体外验证，也可以通过原位杂交和酵母单杂交等方法进行体内验证。
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3楼2013-02-10 13:10:49
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lixg

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xy656691: 金币+8 2013-06-02 10:56:01
首先进行ChIP-sequencing,然后进行EMSA和酵母单杂交验证。
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4楼2013-02-11 08:21:13
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

用CHIP-chip，CHIP芯片技术很方便。
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5楼2013-08-26 23:06:38
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