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suanguozi

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助,系统发育树

分子实验测序后的序列在NCBI上比对后,找到其近缘种,请问大家这个近缘种的来源怎么找啊,老师急着要,可愁死我了,一堆英文看不懂啊,大家帮帮忙,谢谢啦
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weebug

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
zhang8826857: 金币+1, 鼓励应助 2013-01-19 21:15:37
看NCBI比对列表里有什么近缘种,比如出现最多的列,或在测序前就已被告知的物种。。
天蓝蓝兮日头晒
4楼2013-01-19 19:03:09
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suanguozi

新虫 (初入文坛)

大家帮帮忙啊,不胜感激啊
2楼2013-01-18 21:39:13
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蜂火戏猪猴

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhang8826857: 金币+3, 鼓励新虫 2013-01-19 21:15:43
来源?点开那个菌株的链接都应该有的啊,包括上传人、来源、日期等很多信息啊!找个英语好的帮看看就行了!
3楼2013-01-19 10:26:51
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螺旋的歌

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

既然都比对了,在BLAST出来的结果中,找7-8条序列的相似高的序列(MAX IDENT数值高的序列,注意不要选到人工合成的序列),然后载下来,在用MEGA建树吧。
5楼2013-03-14 23:34:14
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