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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 求助，系统发育树
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suanguozi

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助，系统发育树

分子实验测序后的序列在NCBI上比对后，找到其近缘种，请问大家这个近缘种的来源怎么找啊，老师急着要，可愁死我了，一堆英文看不懂啊，大家帮帮忙，谢谢啦
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1楼2013-01-18 21:37:39
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蜂火戏猪猴

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhang8826857: 金币+3, 鼓励新虫 2013-01-19 21:15:43
来源？点开那个菌株的链接都应该有的啊，包括上传人、来源、日期等很多信息啊！找个英语好的帮看看就行了！
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3楼2013-01-19 10:26:51
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suanguozi

新虫 (初入文坛)
大家帮帮忙啊，不胜感激啊
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2楼2013-01-18 21:39:13
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weebug

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
zhang8826857: 金币+1, 鼓励应助 2013-01-19 21:15:37
看NCBI比对列表里有什么近缘种，比如出现最多的列，或在测序前就已被告知的物种。。
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天蓝蓝兮日头晒
4楼2013-01-19 19:03:09
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螺旋的歌

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

既然都比对了，在BLAST出来的结果中，找7-8条序列的相似高的序列(MAX IDENT数值高的序列，注意不要选到人工合成的序列)，然后载下来，在用MEGA建树吧。
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5楼2013-03-14 23:34:14
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